Protein–RNA interactions for Protein: P51945

Ccng1, Cyclin-G1, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccng1P51945 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccng1P51945 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccng1P51945 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccng1P51945 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccng1P51945 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccng1P51945 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccng1P51945 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccng1P51945 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccng1P51945 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccng1P51945 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccng1P51945 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccng1P51945 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccng1P51945 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccng1P51945 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccng1P51945 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccng1P51945 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccng1P51945 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccng1P51945 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccng1P51945 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccng1P51945 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccng1P51945 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccng1P51945 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccng1P51945 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccng1P51945 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccng1P51945 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccng1P51945 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccng1P51945 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccng1P51945 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccng1P51945 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccng1P51945 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccng1P51945 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccng1P51945 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccng1P51945 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccng1P51945 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccng1P51945 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccng1P51945 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccng1P51945 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccng1P51945 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccng1P51945 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccng1P51945 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccng1P51945 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccng1P51945 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccng1P51945 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccng1P51945 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccng1P51945 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccng1P51945 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccng1P51945 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccng1P51945 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccng1P51945 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccng1P51945 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccng1P51945 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccng1P51945 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccng1P51945 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccng1P51945 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccng1P51945 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccng1P51945 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccng1P51945 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccng1P51945 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccng1P51945 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccng1P51945 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccng1P51945 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccng1P51945 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccng1P51945 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccng1P51945 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccng1P51945 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccng1P51945 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccng1P51945 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccng1P51945 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccng1P51945 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccng1P51945 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccng1P51945 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccng1P51945 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccng1P51945 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccng1P51945 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccng1P51945 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccng1P51945 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccng1P51945 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccng1P51945 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccng1P51945 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccng1P51945 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccng1P51945 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccng1P51945 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccng1P51945 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccng1P51945 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccng1P51945 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccng1P51945 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccng1P51945 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccng1P51945 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccng1P51945 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccng1P51945 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccng1P51945 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccng1P51945 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccng1P51945 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccng1P51945 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccng1P51945 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccng1P51945 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccng1P51945 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccng1P51945 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccng1P51945 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccng1P51945 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1222.2 ms