Protein–RNA interactions for Protein: P49452

Cenpc, Centromere protein C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpcP49452 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CenpcP49452 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CenpcP49452 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CenpcP49452 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CenpcP49452 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CenpcP49452 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CenpcP49452 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CenpcP49452 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpcP49452 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CenpcP49452 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CenpcP49452 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CenpcP49452 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CenpcP49452 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CenpcP49452 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CenpcP49452 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CenpcP49452 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CenpcP49452 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CenpcP49452 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CenpcP49452 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CenpcP49452 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CenpcP49452 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CenpcP49452 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CenpcP49452 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CenpcP49452 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CenpcP49452 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CenpcP49452 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CenpcP49452 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CenpcP49452 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CenpcP49452 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CenpcP49452 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CenpcP49452 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CenpcP49452 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CenpcP49452 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CenpcP49452 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CenpcP49452 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CenpcP49452 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CenpcP49452 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CenpcP49452 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CenpcP49452 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CenpcP49452 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CenpcP49452 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CenpcP49452 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CenpcP49452 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CenpcP49452 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CenpcP49452 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CenpcP49452 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CenpcP49452 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CenpcP49452 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CenpcP49452 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CenpcP49452 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CenpcP49452 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CenpcP49452 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CenpcP49452 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CenpcP49452 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CenpcP49452 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CenpcP49452 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CenpcP49452 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CenpcP49452 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CenpcP49452 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CenpcP49452 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CenpcP49452 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CenpcP49452 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CenpcP49452 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CenpcP49452 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CenpcP49452 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CenpcP49452 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CenpcP49452 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CenpcP49452 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CenpcP49452 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CenpcP49452 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CenpcP49452 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CenpcP49452 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CenpcP49452 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CenpcP49452 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CenpcP49452 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CenpcP49452 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CenpcP49452 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CenpcP49452 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CenpcP49452 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CenpcP49452 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CenpcP49452 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CenpcP49452 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CenpcP49452 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CenpcP49452 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CenpcP49452 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CenpcP49452 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CenpcP49452 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CenpcP49452 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CenpcP49452 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CenpcP49452 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CenpcP49452 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CenpcP49452 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CenpcP49452 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CenpcP49452 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CenpcP49452 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CenpcP49452 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CenpcP49452 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CenpcP49452 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CenpcP49452 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CenpcP49452 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms