Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpl5P47962 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpl5P47962 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpl5P47962 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpl5P47962 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpl5P47962 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpl5P47962 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpl5P47962 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpl5P47962 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rpl5P47962 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rpl5P47962 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpl5P47962 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpl5P47962 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpl5P47962 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpl5P47962 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpl5P47962 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpl5P47962 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpl5P47962 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpl5P47962 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpl5P47962 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpl5P47962 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpl5P47962 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpl5P47962 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpl5P47962 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpl5P47962 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpl5P47962 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpl5P47962 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rpl5P47962 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rpl5P47962 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpl5P47962 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpl5P47962 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpl5P47962 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpl5P47962 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpl5P47962 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpl5P47962 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpl5P47962 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpl5P47962 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpl5P47962 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpl5P47962 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpl5P47962 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpl5P47962 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpl5P47962 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpl5P47962 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpl5P47962 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpl5P47962 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpl5P47962 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpl5P47962 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpl5P47962 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpl5P47962 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rpl5P47962 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rpl5P47962 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpl5P47962 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpl5P47962 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpl5P47962 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpl5P47962 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpl5P47962 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl5P47962 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl5P47962 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl5P47962 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl5P47962 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl5P47962 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl5P47962 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpl5P47962 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpl5P47962 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpl5P47962 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpl5P47962 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpl5P47962 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpl5P47962 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpl5P47962 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl5P47962 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl5P47962 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rpl5P47962 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpl5P47962 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpl5P47962 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpl5P47962 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl5P47962 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl5P47962 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl5P47962 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl5P47962 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl5P47962 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl5P47962 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl5P47962 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl5P47962 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl5P47962 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl5P47962 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpl5P47962 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpl5P47962 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpl5P47962 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpl5P47962 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl5P47962 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl5P47962 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpl5P47962 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl5P47962 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl5P47962 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl5P47962 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl5P47962 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl5P47962 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl5P47962 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpl5P47962 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpl5P47962 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms