Protein–RNA interactions for Protein: P47878

Igfbp3, Insulin-like growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp3P47878 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Igfbp3P47878 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Igfbp3P47878 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Igfbp3P47878 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Igfbp3P47878 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Igfbp3P47878 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igfbp3P47878 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igfbp3P47878 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igfbp3P47878 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igfbp3P47878 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igfbp3P47878 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igfbp3P47878 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igfbp3P47878 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igfbp3P47878 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Igfbp3P47878 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Igfbp3P47878 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Igfbp3P47878 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Igfbp3P47878 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Igfbp3P47878 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Igfbp3P47878 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igfbp3P47878 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igfbp3P47878 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Igfbp3P47878 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Igfbp3P47878 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Igfbp3P47878 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Igfbp3P47878 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Igfbp3P47878 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Igfbp3P47878 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Igfbp3P47878 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Igfbp3P47878 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Igfbp3P47878 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Igfbp3P47878 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Igfbp3P47878 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Igfbp3P47878 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Igfbp3P47878 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Igfbp3P47878 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Igfbp3P47878 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Igfbp3P47878 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Igfbp3P47878 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Igfbp3P47878 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Igfbp3P47878 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Igfbp3P47878 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Igfbp3P47878 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Igfbp3P47878 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Igfbp3P47878 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Igfbp3P47878 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Igfbp3P47878 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Igfbp3P47878 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Igfbp3P47878 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Igfbp3P47878 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Igfbp3P47878 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Igfbp3P47878 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Igfbp3P47878 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Igfbp3P47878 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Igfbp3P47878 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Igfbp3P47878 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Igfbp3P47878 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Igfbp3P47878 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Igfbp3P47878 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Igfbp3P47878 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Igfbp3P47878 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Igfbp3P47878 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Igfbp3P47878 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Igfbp3P47878 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Igfbp3P47878 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Igfbp3P47878 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Igfbp3P47878 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Igfbp3P47878 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Igfbp3P47878 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Igfbp3P47878 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Igfbp3P47878 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Igfbp3P47878 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Igfbp3P47878 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Igfbp3P47878 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Igfbp3P47878 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Igfbp3P47878 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Igfbp3P47878 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Igfbp3P47878 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Igfbp3P47878 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Igfbp3P47878 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Igfbp3P47878 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Igfbp3P47878 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Igfbp3P47878 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Igfbp3P47878 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Igfbp3P47878 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Igfbp3P47878 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Igfbp3P47878 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Igfbp3P47878 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Igfbp3P47878 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Igfbp3P47878 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Igfbp3P47878 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Igfbp3P47878 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Igfbp3P47878 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Igfbp3P47878 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Igfbp3P47878 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Igfbp3P47878 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Igfbp3P47878 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Igfbp3P47878 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms