Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccr7P47774 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccr7P47774 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccr7P47774 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccr7P47774 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccr7P47774 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccr7P47774 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccr7P47774 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccr7P47774 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccr7P47774 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccr7P47774 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccr7P47774 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccr7P47774 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccr7P47774 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccr7P47774 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccr7P47774 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccr7P47774 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccr7P47774 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccr7P47774 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccr7P47774 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccr7P47774 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccr7P47774 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccr7P47774 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccr7P47774 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccr7P47774 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccr7P47774 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccr7P47774 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccr7P47774 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccr7P47774 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccr7P47774 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccr7P47774 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccr7P47774 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccr7P47774 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccr7P47774 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccr7P47774 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccr7P47774 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccr7P47774 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccr7P47774 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccr7P47774 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccr7P47774 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccr7P47774 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccr7P47774 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccr7P47774 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccr7P47774 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccr7P47774 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccr7P47774 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccr7P47774 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccr7P47774 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccr7P47774 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccr7P47774 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccr7P47774 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccr7P47774 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccr7P47774 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccr7P47774 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccr7P47774 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccr7P47774 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccr7P47774 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccr7P47774 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccr7P47774 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccr7P47774 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccr7P47774 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccr7P47774 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccr7P47774 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccr7P47774 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccr7P47774 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccr7P47774 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccr7P47774 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccr7P47774 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccr7P47774 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccr7P47774 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccr7P47774 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccr7P47774 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccr7P47774 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccr7P47774 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccr7P47774 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccr7P47774 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccr7P47774 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccr7P47774 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccr7P47774 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccr7P47774 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccr7P47774 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccr7P47774 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccr7P47774 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccr7P47774 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccr7P47774 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccr7P47774 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccr7P47774 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccr7P47774 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccr7P47774 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccr7P47774 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccr7P47774 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccr7P47774 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccr7P47774 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccr7P47774 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccr7P47774 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccr7P47774 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccr7P47774 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccr7P47774 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccr7P47774 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccr7P47774 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms