Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tac1P41539 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tac1P41539 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tac1P41539 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tac1P41539 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tac1P41539 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tac1P41539 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tac1P41539 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tac1P41539 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tac1P41539 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tac1P41539 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tac1P41539 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tac1P41539 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tac1P41539 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tac1P41539 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tac1P41539 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tac1P41539 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tac1P41539 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tac1P41539 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tac1P41539 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tac1P41539 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tac1P41539 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tac1P41539 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tac1P41539 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tac1P41539 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tac1P41539 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tac1P41539 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tac1P41539 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tac1P41539 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tac1P41539 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tac1P41539 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tac1P41539 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tac1P41539 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tac1P41539 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tac1P41539 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tac1P41539 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tac1P41539 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tac1P41539 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tac1P41539 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tac1P41539 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tac1P41539 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tac1P41539 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tac1P41539 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tac1P41539 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tac1P41539 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tac1P41539 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tac1P41539 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tac1P41539 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tac1P41539 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tac1P41539 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tac1P41539 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tac1P41539 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tac1P41539 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tac1P41539 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tac1P41539 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tac1P41539 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tac1P41539 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tac1P41539 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tac1P41539 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tac1P41539 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tac1P41539 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tac1P41539 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tac1P41539 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tac1P41539 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tac1P41539 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tac1P41539 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tac1P41539 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tac1P41539 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tac1P41539 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tac1P41539 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tac1P41539 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tac1P41539 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tac1P41539 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tac1P41539 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tac1P41539 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tac1P41539 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tac1P41539 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tac1P41539 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tac1P41539 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tac1P41539 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tac1P41539 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tac1P41539 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tac1P41539 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tac1P41539 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tac1P41539 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tac1P41539 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tac1P41539 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tac1P41539 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tac1P41539 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tac1P41539 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tac1P41539 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tac1P41539 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tac1P41539 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tac1P41539 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tac1P41539 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tac1P41539 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tac1P41539 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tac1P41539 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tac1P41539 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tac1P41539 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.7 ms