Protein–RNA interactions for Protein: P41164

Etv1, ETS translocation variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv1P41164 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Etv1P41164 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Etv1P41164 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Etv1P41164 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Etv1P41164 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Etv1P41164 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Etv1P41164 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Etv1P41164 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Etv1P41164 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Etv1P41164 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Etv1P41164 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Etv1P41164 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Etv1P41164 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Etv1P41164 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Etv1P41164 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Etv1P41164 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Etv1P41164 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Etv1P41164 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Etv1P41164 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Etv1P41164 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Etv1P41164 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Etv1P41164 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Etv1P41164 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Etv1P41164 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Etv1P41164 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Etv1P41164 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Etv1P41164 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Etv1P41164 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Etv1P41164 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Etv1P41164 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Etv1P41164 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Etv1P41164 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Etv1P41164 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Etv1P41164 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Etv1P41164 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Etv1P41164 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Etv1P41164 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Etv1P41164 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Etv1P41164 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Etv1P41164 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Etv1P41164 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Etv1P41164 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Etv1P41164 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Etv1P41164 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Etv1P41164 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Etv1P41164 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Etv1P41164 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Etv1P41164 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Etv1P41164 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Etv1P41164 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Etv1P41164 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Etv1P41164 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Etv1P41164 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Etv1P41164 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Etv1P41164 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Etv1P41164 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Etv1P41164 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Etv1P41164 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Etv1P41164 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Etv1P41164 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Etv1P41164 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Etv1P41164 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Etv1P41164 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Etv1P41164 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Etv1P41164 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Etv1P41164 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Etv1P41164 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Etv1P41164 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Etv1P41164 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Etv1P41164 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Etv1P41164 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Etv1P41164 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Etv1P41164 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Etv1P41164 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Etv1P41164 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Etv1P41164 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Etv1P41164 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Etv1P41164 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Etv1P41164 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Etv1P41164 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Etv1P41164 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Etv1P41164 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Etv1P41164 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Etv1P41164 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Etv1P41164 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Etv1P41164 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Etv1P41164 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Etv1P41164 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Etv1P41164 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Etv1P41164 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Etv1P41164 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Etv1P41164 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Etv1P41164 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Etv1P41164 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Etv1P41164 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Etv1P41164 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Etv1P41164 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Etv1P41164 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Etv1P41164 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Etv1P41164 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms