Protein–RNA interactions for Protein: P40645

Sox6, Transcription factor SOX-6, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox6P40645 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox6P40645 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox6P40645 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox6P40645 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox6P40645 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox6P40645 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox6P40645 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox6P40645 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox6P40645 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox6P40645 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox6P40645 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox6P40645 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox6P40645 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox6P40645 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox6P40645 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox6P40645 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox6P40645 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox6P40645 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox6P40645 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox6P40645 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox6P40645 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox6P40645 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox6P40645 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox6P40645 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox6P40645 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox6P40645 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox6P40645 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox6P40645 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox6P40645 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox6P40645 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox6P40645 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox6P40645 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox6P40645 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox6P40645 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox6P40645 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sox6P40645 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sox6P40645 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sox6P40645 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sox6P40645 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox6P40645 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox6P40645 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox6P40645 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox6P40645 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox6P40645 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox6P40645 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox6P40645 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox6P40645 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox6P40645 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox6P40645 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox6P40645 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox6P40645 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox6P40645 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox6P40645 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox6P40645 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox6P40645 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox6P40645 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox6P40645 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox6P40645 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox6P40645 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox6P40645 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox6P40645 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox6P40645 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox6P40645 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox6P40645 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox6P40645 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox6P40645 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox6P40645 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox6P40645 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox6P40645 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox6P40645 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox6P40645 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox6P40645 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox6P40645 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox6P40645 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox6P40645 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox6P40645 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox6P40645 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox6P40645 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox6P40645 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox6P40645 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox6P40645 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox6P40645 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox6P40645 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox6P40645 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox6P40645 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox6P40645 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox6P40645 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox6P40645 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox6P40645 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox6P40645 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox6P40645 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox6P40645 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox6P40645 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox6P40645 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sox6P40645 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox6P40645 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox6P40645 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox6P40645 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox6P40645 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox6P40645 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.6 ms