Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Timp3P39876 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Timp3P39876 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Timp3P39876 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Timp3P39876 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Timp3P39876 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Timp3P39876 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Timp3P39876 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Timp3P39876 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Timp3P39876 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Timp3P39876 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Timp3P39876 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Timp3P39876 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Timp3P39876 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Timp3P39876 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Timp3P39876 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Timp3P39876 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Timp3P39876 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Timp3P39876 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Timp3P39876 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Timp3P39876 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Timp3P39876 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Timp3P39876 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Timp3P39876 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Timp3P39876 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Timp3P39876 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Timp3P39876 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Timp3P39876 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Timp3P39876 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Timp3P39876 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Timp3P39876 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Timp3P39876 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Timp3P39876 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Timp3P39876 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Timp3P39876 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Timp3P39876 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Timp3P39876 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Timp3P39876 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Timp3P39876 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Timp3P39876 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Timp3P39876 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Timp3P39876 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Timp3P39876 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Timp3P39876 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Timp3P39876 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Timp3P39876 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Timp3P39876 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Timp3P39876 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Timp3P39876 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Timp3P39876 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Timp3P39876 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Timp3P39876 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Timp3P39876 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Timp3P39876 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Timp3P39876 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Timp3P39876 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Timp3P39876 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Timp3P39876 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Timp3P39876 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Timp3P39876 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Timp3P39876 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Timp3P39876 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Timp3P39876 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Timp3P39876 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Timp3P39876 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Timp3P39876 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Timp3P39876 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Timp3P39876 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Timp3P39876 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Timp3P39876 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Timp3P39876 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Timp3P39876 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Timp3P39876 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Timp3P39876 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Timp3P39876 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Timp3P39876 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Timp3P39876 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Timp3P39876 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Timp3P39876 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Timp3P39876 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Timp3P39876 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Timp3P39876 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Timp3P39876 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Timp3P39876 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Timp3P39876 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Timp3P39876 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Timp3P39876 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Timp3P39876 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Timp3P39876 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Timp3P39876 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Timp3P39876 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Timp3P39876 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Timp3P39876 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Timp3P39876 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Timp3P39876 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Timp3P39876 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Timp3P39876 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Timp3P39876 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timp3P39876 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timp3P39876 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms