Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PpargP37238 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PpargP37238 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PpargP37238 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PpargP37238 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PpargP37238 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PpargP37238 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PpargP37238 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PpargP37238 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PpargP37238 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PpargP37238 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PpargP37238 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PpargP37238 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PpargP37238 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PpargP37238 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PpargP37238 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PpargP37238 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PpargP37238 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PpargP37238 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PpargP37238 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PpargP37238 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PpargP37238 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PpargP37238 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PpargP37238 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PpargP37238 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PpargP37238 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PpargP37238 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PpargP37238 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PpargP37238 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PpargP37238 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PpargP37238 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PpargP37238 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PpargP37238 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PpargP37238 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PpargP37238 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PpargP37238 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PpargP37238 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PpargP37238 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PpargP37238 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PpargP37238 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PpargP37238 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PpargP37238 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PpargP37238 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PpargP37238 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PpargP37238 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PpargP37238 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PpargP37238 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PpargP37238 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PpargP37238 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PpargP37238 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PpargP37238 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PpargP37238 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PpargP37238 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PpargP37238 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PpargP37238 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PpargP37238 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PpargP37238 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PpargP37238 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PpargP37238 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PpargP37238 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PpargP37238 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PpargP37238 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PpargP37238 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PpargP37238 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PpargP37238 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PpargP37238 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PpargP37238 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PpargP37238 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PpargP37238 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PpargP37238 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PpargP37238 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PpargP37238 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PpargP37238 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PpargP37238 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PpargP37238 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PpargP37238 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PpargP37238 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PpargP37238 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PpargP37238 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PpargP37238 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PpargP37238 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PpargP37238 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PpargP37238 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PpargP37238 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PpargP37238 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PpargP37238 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PpargP37238 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PpargP37238 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PpargP37238 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PpargP37238 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PpargP37238 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PpargP37238 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PpargP37238 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PpargP37238 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PpargP37238 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PpargP37238 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PpargP37238 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PpargP37238 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PpargP37238 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PpargP37238 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms