Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ercc5P35689 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ercc5P35689 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ercc5P35689 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ercc5P35689 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ercc5P35689 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ercc5P35689 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ercc5P35689 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ercc5P35689 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ercc5P35689 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Ercc5P35689 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc5P35689 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc5P35689 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc5P35689 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc5P35689 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ercc5P35689 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Ercc5P35689 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ercc5P35689 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ercc5P35689 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ercc5P35689 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ercc5P35689 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ercc5P35689 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ercc5P35689 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ercc5P35689 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ercc5P35689 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ercc5P35689 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ercc5P35689 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ercc5P35689 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ercc5P35689 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ercc5P35689 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ercc5P35689 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ercc5P35689 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ercc5P35689 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ercc5P35689 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ercc5P35689 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ercc5P35689 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ercc5P35689 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ercc5P35689 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ercc5P35689 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ercc5P35689 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Ercc5P35689 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ercc5P35689 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ercc5P35689 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ercc5P35689 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc5P35689 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc5P35689 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc5P35689 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ercc5P35689 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ercc5P35689 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ercc5P35689 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ercc5P35689 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ercc5P35689 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ercc5P35689 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ercc5P35689 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ercc5P35689 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ercc5P35689 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ercc5P35689 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc5P35689 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc5P35689 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc5P35689 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc5P35689 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ercc5P35689 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ercc5P35689 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ercc5P35689 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ercc5P35689 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ercc5P35689 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ercc5P35689 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ercc5P35689 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ercc5P35689 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ercc5P35689 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc5P35689 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ercc5P35689 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ercc5P35689 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc5P35689 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc5P35689 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc5P35689 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc5P35689 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc5P35689 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc5P35689 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc5P35689 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ercc5P35689 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ercc5P35689 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ercc5P35689 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ercc5P35689 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ercc5P35689 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ercc5P35689 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc5P35689 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ercc5P35689 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
Ercc5P35689 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ercc5P35689 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ercc5P35689 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ercc5P35689 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ercc5P35689 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc5P35689 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ercc5P35689 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ercc5P35689 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ercc5P35689 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc5P35689 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc5P35689 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc5P35689 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 267 ms