Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Rab23P35288 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Rab23P35288 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rab23P35288 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab23P35288 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab23P35288 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab23P35288 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rab23P35288 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rab23P35288 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rab23P35288 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rab23P35288 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rab23P35288 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rab23P35288 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rab23P35288 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rab23P35288 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rab23P35288 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rab23P35288 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rab23P35288 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rab23P35288 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rab23P35288 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rab23P35288 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rab23P35288 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab23P35288 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab23P35288 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab23P35288 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab23P35288 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rab23P35288 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rab23P35288 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rab23P35288 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab23P35288 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab23P35288 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rab23P35288 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rab23P35288 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rab23P35288 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rab23P35288 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rab23P35288 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rab23P35288 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab23P35288 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab23P35288 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab23P35288 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab23P35288 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab23P35288 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab23P35288 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab23P35288 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab23P35288 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab23P35288 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab23P35288 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab23P35288 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab23P35288 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab23P35288 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab23P35288 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab23P35288 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab23P35288 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab23P35288 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab23P35288 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab23P35288 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab23P35288 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab23P35288 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab23P35288 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab23P35288 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab23P35288 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab23P35288 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab23P35288 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab23P35288 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab23P35288 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab23P35288 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab23P35288 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab23P35288 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab23P35288 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab23P35288 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab23P35288 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab23P35288 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab23P35288 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab23P35288 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab23P35288 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab23P35288 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab23P35288 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab23P35288 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab23P35288 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab23P35288 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab23P35288 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab23P35288 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab23P35288 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab23P35288 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab23P35288 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab23P35288 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab23P35288 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab23P35288 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab23P35288 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab23P35288 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab23P35288 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab23P35288 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab23P35288 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rab23P35288 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rab23P35288 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rab23P35288 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab23P35288 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab23P35288 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab23P35288 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab23P35288 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms