Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stfa3P35173 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stfa3P35173 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stfa3P35173 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stfa3P35173 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stfa3P35173 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stfa3P35173 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stfa3P35173 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stfa3P35173 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stfa3P35173 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stfa3P35173 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stfa3P35173 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stfa3P35173 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stfa3P35173 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stfa3P35173 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stfa3P35173 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stfa3P35173 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stfa3P35173 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stfa3P35173 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stfa3P35173 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stfa3P35173 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stfa3P35173 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stfa3P35173 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stfa3P35173 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stfa3P35173 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stfa3P35173 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stfa3P35173 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stfa3P35173 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stfa3P35173 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stfa3P35173 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stfa3P35173 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stfa3P35173 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stfa3P35173 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stfa3P35173 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stfa3P35173 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stfa3P35173 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stfa3P35173 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stfa3P35173 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stfa3P35173 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stfa3P35173 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stfa3P35173 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stfa3P35173 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stfa3P35173 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stfa3P35173 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stfa3P35173 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stfa3P35173 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stfa3P35173 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stfa3P35173 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stfa3P35173 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stfa3P35173 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stfa3P35173 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stfa3P35173 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stfa3P35173 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stfa3P35173 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stfa3P35173 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stfa3P35173 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stfa3P35173 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Stfa3P35173 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stfa3P35173 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stfa3P35173 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stfa3P35173 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stfa3P35173 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stfa3P35173 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Stfa3P35173 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stfa3P35173 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Stfa3P35173 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stfa3P35173 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stfa3P35173 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stfa3P35173 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stfa3P35173 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stfa3P35173 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stfa3P35173 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stfa3P35173 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stfa3P35173 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stfa3P35173 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stfa3P35173 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stfa3P35173 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stfa3P35173 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stfa3P35173 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stfa3P35173 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stfa3P35173 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stfa3P35173 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stfa3P35173 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stfa3P35173 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stfa3P35173 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stfa3P35173 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stfa3P35173 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stfa3P35173 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stfa3P35173 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stfa3P35173 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stfa3P35173 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stfa3P35173 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stfa3P35173 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stfa3P35173 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stfa3P35173 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stfa3P35173 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stfa3P35173 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stfa3P35173 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stfa3P35173 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stfa3P35173 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms