Protein–RNA interactions for Protein: P31955

Areg, Amphiregulin, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AregP31955 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AregP31955 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AregP31955 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AregP31955 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AregP31955 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AregP31955 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AregP31955 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AregP31955 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AregP31955 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AregP31955 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AregP31955 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AregP31955 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AregP31955 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AregP31955 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AregP31955 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AregP31955 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AregP31955 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AregP31955 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AregP31955 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AregP31955 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AregP31955 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AregP31955 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AregP31955 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AregP31955 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
AregP31955 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AregP31955 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AregP31955 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AregP31955 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AregP31955 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AregP31955 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AregP31955 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AregP31955 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AregP31955 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AregP31955 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AregP31955 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AregP31955 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AregP31955 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AregP31955 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AregP31955 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AregP31955 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AregP31955 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
AregP31955 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AregP31955 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AregP31955 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AregP31955 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AregP31955 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AregP31955 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AregP31955 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AregP31955 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AregP31955 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AregP31955 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AregP31955 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AregP31955 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AregP31955 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AregP31955 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AregP31955 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
AregP31955 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AregP31955 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AregP31955 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AregP31955 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AregP31955 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AregP31955 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AregP31955 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AregP31955 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AregP31955 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AregP31955 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AregP31955 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
AregP31955 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AregP31955 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AregP31955 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AregP31955 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AregP31955 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AregP31955 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AregP31955 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AregP31955 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AregP31955 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AregP31955 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AregP31955 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AregP31955 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AregP31955 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AregP31955 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AregP31955 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AregP31955 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AregP31955 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AregP31955 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AregP31955 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AregP31955 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AregP31955 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AregP31955 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AregP31955 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AregP31955 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AregP31955 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AregP31955 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AregP31955 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AregP31955 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AregP31955 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AregP31955 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AregP31955 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AregP31955 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AregP31955 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.4 ms