Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gsx2P31316 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gsx2P31316 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gsx2P31316 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gsx2P31316 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gsx2P31316 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gsx2P31316 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gsx2P31316 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gsx2P31316 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gsx2P31316 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gsx2P31316 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gsx2P31316 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gsx2P31316 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gsx2P31316 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gsx2P31316 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gsx2P31316 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gsx2P31316 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gsx2P31316 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gsx2P31316 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gsx2P31316 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gsx2P31316 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gsx2P31316 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gsx2P31316 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gsx2P31316 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gsx2P31316 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gsx2P31316 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gsx2P31316 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gsx2P31316 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gsx2P31316 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gsx2P31316 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gsx2P31316 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gsx2P31316 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gsx2P31316 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gsx2P31316 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gsx2P31316 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gsx2P31316 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gsx2P31316 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gsx2P31316 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gsx2P31316 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gsx2P31316 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gsx2P31316 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gsx2P31316 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gsx2P31316 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gsx2P31316 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gsx2P31316 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gsx2P31316 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gsx2P31316 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gsx2P31316 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gsx2P31316 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gsx2P31316 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gsx2P31316 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gsx2P31316 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gsx2P31316 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gsx2P31316 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gsx2P31316 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gsx2P31316 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gsx2P31316 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gsx2P31316 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gsx2P31316 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gsx2P31316 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gsx2P31316 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gsx2P31316 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gsx2P31316 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gsx2P31316 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gsx2P31316 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gsx2P31316 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gsx2P31316 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gsx2P31316 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gsx2P31316 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gsx2P31316 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gsx2P31316 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gsx2P31316 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gsx2P31316 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gsx2P31316 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gsx2P31316 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gsx2P31316 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gsx2P31316 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gsx2P31316 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gsx2P31316 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gsx2P31316 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gsx2P31316 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gsx2P31316 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gsx2P31316 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gsx2P31316 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gsx2P31316 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gsx2P31316 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gsx2P31316 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gsx2P31316 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gsx2P31316 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gsx2P31316 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gsx2P31316 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gsx2P31316 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gsx2P31316 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gsx2P31316 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gsx2P31316 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gsx2P31316 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gsx2P31316 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gsx2P31316 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gsx2P31316 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gsx2P31316 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms