Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd28P31041 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd28P31041 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd28P31041 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd28P31041 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd28P31041 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd28P31041 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd28P31041 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd28P31041 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cd28P31041 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd28P31041 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd28P31041 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd28P31041 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd28P31041 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd28P31041 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd28P31041 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd28P31041 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd28P31041 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd28P31041 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd28P31041 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd28P31041 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd28P31041 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd28P31041 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd28P31041 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd28P31041 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd28P31041 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd28P31041 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd28P31041 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd28P31041 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd28P31041 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd28P31041 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd28P31041 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd28P31041 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd28P31041 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd28P31041 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd28P31041 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd28P31041 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd28P31041 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd28P31041 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd28P31041 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd28P31041 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd28P31041 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd28P31041 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd28P31041 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd28P31041 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd28P31041 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd28P31041 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd28P31041 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd28P31041 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd28P31041 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd28P31041 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd28P31041 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd28P31041 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd28P31041 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd28P31041 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd28P31041 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd28P31041 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd28P31041 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd28P31041 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd28P31041 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd28P31041 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd28P31041 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd28P31041 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd28P31041 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd28P31041 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd28P31041 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd28P31041 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd28P31041 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd28P31041 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd28P31041 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd28P31041 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd28P31041 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd28P31041 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd28P31041 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd28P31041 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd28P31041 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd28P31041 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd28P31041 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd28P31041 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd28P31041 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd28P31041 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd28P31041 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd28P31041 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd28P31041 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd28P31041 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd28P31041 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd28P31041 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd28P31041 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd28P31041 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd28P31041 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd28P31041 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd28P31041 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd28P31041 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd28P31041 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd28P31041 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd28P31041 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd28P31041 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd28P31041 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd28P31041 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd28P31041 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms