Protein–RNA interactions for Protein: P28293

Ctsg, Cathepsin G, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsgP28293 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsgP28293 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsgP28293 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsgP28293 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtsgP28293 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtsgP28293 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CtsgP28293 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtsgP28293 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtsgP28293 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
CtsgP28293 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtsgP28293 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtsgP28293 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsgP28293 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsgP28293 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsgP28293 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsgP28293 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsgP28293 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtsgP28293 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtsgP28293 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CtsgP28293 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtsgP28293 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtsgP28293 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtsgP28293 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtsgP28293 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtsgP28293 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CtsgP28293 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtsgP28293 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtsgP28293 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsgP28293 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsgP28293 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsgP28293 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsgP28293 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtsgP28293 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtsgP28293 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtsgP28293 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CtsgP28293 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtsgP28293 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CtsgP28293 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtsgP28293 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtsgP28293 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtsgP28293 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtsgP28293 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtsgP28293 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtsgP28293 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtsgP28293 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtsgP28293 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CtsgP28293 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CtsgP28293 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtsgP28293 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtsgP28293 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtsgP28293 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtsgP28293 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtsgP28293 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtsgP28293 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtsgP28293 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtsgP28293 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtsgP28293 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtsgP28293 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtsgP28293 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtsgP28293 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtsgP28293 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtsgP28293 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtsgP28293 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtsgP28293 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsgP28293 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsgP28293 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsgP28293 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtsgP28293 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtsgP28293 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtsgP28293 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsgP28293 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtsgP28293 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtsgP28293 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtsgP28293 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtsgP28293 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtsgP28293 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtsgP28293 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtsgP28293 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtsgP28293 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtsgP28293 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtsgP28293 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtsgP28293 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtsgP28293 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CtsgP28293 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CtsgP28293 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CtsgP28293 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtsgP28293 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtsgP28293 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtsgP28293 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtsgP28293 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtsgP28293 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtsgP28293 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtsgP28293 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CtsgP28293 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtsgP28293 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsgP28293 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsgP28293 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsgP28293 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsgP28293 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsgP28293 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms