Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pou3f1P21952 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pou3f1P21952 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pou3f1P21952 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pou3f1P21952 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pou3f1P21952 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pou3f1P21952 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pou3f1P21952 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pou3f1P21952 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pou3f1P21952 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pou3f1P21952 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pou3f1P21952 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pou3f1P21952 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pou3f1P21952 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pou3f1P21952 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pou3f1P21952 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pou3f1P21952 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pou3f1P21952 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pou3f1P21952 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pou3f1P21952 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pou3f1P21952 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pou3f1P21952 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pou3f1P21952 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pou3f1P21952 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pou3f1P21952 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pou3f1P21952 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pou3f1P21952 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pou3f1P21952 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pou3f1P21952 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pou3f1P21952 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pou3f1P21952 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pou3f1P21952 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pou3f1P21952 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pou3f1P21952 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pou3f1P21952 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pou3f1P21952 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pou3f1P21952 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pou3f1P21952 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pou3f1P21952 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pou3f1P21952 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pou3f1P21952 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pou3f1P21952 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pou3f1P21952 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pou3f1P21952 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pou3f1P21952 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pou3f1P21952 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pou3f1P21952 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pou3f1P21952 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pou3f1P21952 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pou3f1P21952 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pou3f1P21952 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pou3f1P21952 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pou3f1P21952 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pou3f1P21952 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pou3f1P21952 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pou3f1P21952 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pou3f1P21952 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pou3f1P21952 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pou3f1P21952 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pou3f1P21952 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pou3f1P21952 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pou3f1P21952 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pou3f1P21952 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pou3f1P21952 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pou3f1P21952 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pou3f1P21952 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pou3f1P21952 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pou3f1P21952 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pou3f1P21952 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pou3f1P21952 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pou3f1P21952 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pou3f1P21952 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pou3f1P21952 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pou3f1P21952 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pou3f1P21952 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pou3f1P21952 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pou3f1P21952 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pou3f1P21952 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pou3f1P21952 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pou3f1P21952 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pou3f1P21952 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou3f1P21952 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pou3f1P21952 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pou3f1P21952 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pou3f1P21952 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pou3f1P21952 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pou3f1P21952 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Pou3f1P21952 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pou3f1P21952 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pou3f1P21952 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pou3f1P21952 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pou3f1P21952 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pou3f1P21952 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pou3f1P21952 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pou3f1P21952 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pou3f1P21952 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pou3f1P21952 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pou3f1P21952 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pou3f1P21952 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pou3f1P21952 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms