Protein–RNA interactions for Protein: P21658

Fgf6, Fibroblast growth factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf6P21658 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf6P21658 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf6P21658 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf6P21658 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf6P21658 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf6P21658 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf6P21658 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf6P21658 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf6P21658 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Fgf6P21658 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf6P21658 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf6P21658 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf6P21658 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf6P21658 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf6P21658 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf6P21658 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf6P21658 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf6P21658 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf6P21658 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgf6P21658 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgf6P21658 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgf6P21658 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgf6P21658 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgf6P21658 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgf6P21658 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fgf6P21658 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fgf6P21658 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fgf6P21658 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fgf6P21658 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgf6P21658 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgf6P21658 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgf6P21658 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgf6P21658 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgf6P21658 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgf6P21658 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgf6P21658 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgf6P21658 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgf6P21658 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fgf6P21658 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgf6P21658 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgf6P21658 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgf6P21658 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fgf6P21658 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fgf6P21658 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fgf6P21658 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fgf6P21658 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fgf6P21658 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fgf6P21658 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fgf6P21658 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fgf6P21658 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fgf6P21658 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fgf6P21658 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgf6P21658 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fgf6P21658 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgf6P21658 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fgf6P21658 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgf6P21658 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fgf6P21658 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fgf6P21658 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fgf6P21658 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fgf6P21658 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fgf6P21658 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fgf6P21658 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fgf6P21658 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fgf6P21658 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fgf6P21658 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fgf6P21658 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fgf6P21658 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fgf6P21658 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fgf6P21658 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fgf6P21658 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fgf6P21658 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fgf6P21658 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fgf6P21658 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fgf6P21658 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fgf6P21658 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fgf6P21658 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fgf6P21658 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fgf6P21658 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fgf6P21658 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fgf6P21658 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fgf6P21658 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fgf6P21658 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fgf6P21658 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fgf6P21658 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Fgf6P21658 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fgf6P21658 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fgf6P21658 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf6P21658 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fgf6P21658 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fgf6P21658 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Fgf6P21658 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fgf6P21658 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgf6P21658 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgf6P21658 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fgf6P21658 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fgf6P21658 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fgf6P21658 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fgf6P21658 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fgf6P21658 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms