Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmnb2P21619 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lmnb2P21619 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lmnb2P21619 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmnb2P21619 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmnb2P21619 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmnb2P21619 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmnb2P21619 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmnb2P21619 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lmnb2P21619 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lmnb2P21619 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lmnb2P21619 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lmnb2P21619 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lmnb2P21619 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lmnb2P21619 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lmnb2P21619 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmnb2P21619 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmnb2P21619 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmnb2P21619 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmnb2P21619 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmnb2P21619 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmnb2P21619 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmnb2P21619 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmnb2P21619 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmnb2P21619 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lmnb2P21619 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmnb2P21619 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmnb2P21619 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmnb2P21619 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmnb2P21619 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmnb2P21619 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmnb2P21619 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmnb2P21619 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmnb2P21619 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmnb2P21619 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmnb2P21619 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmnb2P21619 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmnb2P21619 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmnb2P21619 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lmnb2P21619 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmnb2P21619 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lmnb2P21619 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lmnb2P21619 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lmnb2P21619 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmnb2P21619 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmnb2P21619 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lmnb2P21619 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lmnb2P21619 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmnb2P21619 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmnb2P21619 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmnb2P21619 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmnb2P21619 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmnb2P21619 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmnb2P21619 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmnb2P21619 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmnb2P21619 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmnb2P21619 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmnb2P21619 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmnb2P21619 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmnb2P21619 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmnb2P21619 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmnb2P21619 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmnb2P21619 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Lmnb2P21619 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmnb2P21619 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmnb2P21619 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmnb2P21619 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmnb2P21619 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmnb2P21619 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmnb2P21619 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmnb2P21619 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmnb2P21619 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmnb2P21619 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmnb2P21619 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmnb2P21619 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmnb2P21619 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmnb2P21619 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmnb2P21619 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmnb2P21619 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmnb2P21619 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmnb2P21619 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmnb2P21619 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmnb2P21619 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmnb2P21619 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmnb2P21619 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmnb2P21619 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmnb2P21619 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmnb2P21619 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmnb2P21619 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmnb2P21619 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lmnb2P21619 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lmnb2P21619 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmnb2P21619 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmnb2P21619 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmnb2P21619 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmnb2P21619 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmnb2P21619 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmnb2P21619 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmnb2P21619 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmnb2P21619 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms