Protein–RNA interactions for Protein: P20782

Chrne, Acetylcholine receptor subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrneP20782 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChrneP20782 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChrneP20782 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ChrneP20782 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ChrneP20782 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ChrneP20782 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ChrneP20782 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChrneP20782 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChrneP20782 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChrneP20782 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChrneP20782 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChrneP20782 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChrneP20782 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChrneP20782 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChrneP20782 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChrneP20782 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChrneP20782 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChrneP20782 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ChrneP20782 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChrneP20782 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChrneP20782 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChrneP20782 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChrneP20782 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChrneP20782 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChrneP20782 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChrneP20782 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChrneP20782 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChrneP20782 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChrneP20782 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChrneP20782 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ChrneP20782 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChrneP20782 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChrneP20782 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChrneP20782 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChrneP20782 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ChrneP20782 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ChrneP20782 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ChrneP20782 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ChrneP20782 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ChrneP20782 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChrneP20782 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChrneP20782 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChrneP20782 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChrneP20782 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChrneP20782 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChrneP20782 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChrneP20782 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChrneP20782 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ChrneP20782 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ChrneP20782 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChrneP20782 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChrneP20782 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChrneP20782 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChrneP20782 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChrneP20782 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChrneP20782 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChrneP20782 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChrneP20782 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChrneP20782 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChrneP20782 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChrneP20782 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChrneP20782 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChrneP20782 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChrneP20782 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChrneP20782 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ChrneP20782 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChrneP20782 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ChrneP20782 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChrneP20782 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ChrneP20782 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ChrneP20782 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ChrneP20782 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ChrneP20782 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChrneP20782 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChrneP20782 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChrneP20782 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ChrneP20782 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ChrneP20782 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ChrneP20782 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChrneP20782 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChrneP20782 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChrneP20782 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChrneP20782 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChrneP20782 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChrneP20782 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChrneP20782 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChrneP20782 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ChrneP20782 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChrneP20782 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChrneP20782 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChrneP20782 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChrneP20782 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ChrneP20782 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ChrneP20782 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ChrneP20782 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChrneP20782 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChrneP20782 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChrneP20782 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChrneP20782 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ChrneP20782 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms