Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Prim1P20664 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Prim1P20664 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Prim1P20664 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Prim1P20664 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Prim1P20664 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Prim1P20664 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Prim1P20664 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Prim1P20664 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Prim1P20664 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Prim1P20664 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Prim1P20664 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Prim1P20664 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Prim1P20664 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Prim1P20664 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Prim1P20664 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Prim1P20664 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Prim1P20664 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Prim1P20664 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Prim1P20664 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Prim1P20664 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Prim1P20664 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Prim1P20664 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Prim1P20664 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Prim1P20664 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Prim1P20664 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Prim1P20664 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Prim1P20664 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Prim1P20664 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Prim1P20664 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Prim1P20664 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Prim1P20664 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Prim1P20664 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Prim1P20664 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Prim1P20664 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Prim1P20664 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Prim1P20664 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Prim1P20664 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Prim1P20664 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Prim1P20664 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Prim1P20664 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Prim1P20664 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Prim1P20664 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Prim1P20664 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Prim1P20664 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Prim1P20664 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Prim1P20664 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Prim1P20664 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Prim1P20664 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Prim1P20664 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Prim1P20664 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Prim1P20664 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Prim1P20664 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Prim1P20664 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Prim1P20664 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Prim1P20664 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Prim1P20664 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Prim1P20664 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Prim1P20664 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Prim1P20664 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Prim1P20664 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Prim1P20664 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Prim1P20664 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Prim1P20664 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Prim1P20664 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Prim1P20664 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Prim1P20664 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Prim1P20664 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Prim1P20664 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Prim1P20664 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Prim1P20664 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Prim1P20664 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Prim1P20664 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Prim1P20664 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Prim1P20664 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Prim1P20664 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Prim1P20664 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Prim1P20664 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Prim1P20664 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Prim1P20664 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Prim1P20664 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Prim1P20664 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Prim1P20664 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Prim1P20664 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Prim1P20664 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Prim1P20664 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Prim1P20664 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Prim1P20664 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Prim1P20664 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Prim1P20664 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Prim1P20664 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Prim1P20664 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Prim1P20664 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Prim1P20664 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Prim1P20664 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Prim1P20664 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Prim1P20664 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Prim1P20664 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Prim1P20664 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Prim1P20664 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.8 ms