Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NelfeP19426 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NelfeP19426 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NelfeP19426 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NelfeP19426 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NelfeP19426 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NelfeP19426 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NelfeP19426 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NelfeP19426 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NelfeP19426 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NelfeP19426 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NelfeP19426 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NelfeP19426 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NelfeP19426 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NelfeP19426 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NelfeP19426 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NelfeP19426 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NelfeP19426 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NelfeP19426 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NelfeP19426 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NelfeP19426 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NelfeP19426 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NelfeP19426 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NelfeP19426 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NelfeP19426 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NelfeP19426 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NelfeP19426 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NelfeP19426 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NelfeP19426 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NelfeP19426 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NelfeP19426 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NelfeP19426 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NelfeP19426 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NelfeP19426 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NelfeP19426 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NelfeP19426 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NelfeP19426 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NelfeP19426 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NelfeP19426 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NelfeP19426 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NelfeP19426 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NelfeP19426 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NelfeP19426 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NelfeP19426 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NelfeP19426 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NelfeP19426 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NelfeP19426 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NelfeP19426 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NelfeP19426 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NelfeP19426 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NelfeP19426 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NelfeP19426 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NelfeP19426 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NelfeP19426 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NelfeP19426 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NelfeP19426 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NelfeP19426 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NelfeP19426 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NelfeP19426 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NelfeP19426 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NelfeP19426 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NelfeP19426 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NelfeP19426 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NelfeP19426 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NelfeP19426 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NelfeP19426 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NelfeP19426 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NelfeP19426 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NelfeP19426 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NelfeP19426 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NelfeP19426 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NelfeP19426 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NelfeP19426 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NelfeP19426 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NelfeP19426 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NelfeP19426 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NelfeP19426 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NelfeP19426 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NelfeP19426 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NelfeP19426 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NelfeP19426 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NelfeP19426 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NelfeP19426 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NelfeP19426 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NelfeP19426 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NelfeP19426 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NelfeP19426 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NelfeP19426 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NelfeP19426 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NelfeP19426 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NelfeP19426 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NelfeP19426 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NelfeP19426 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NelfeP19426 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NelfeP19426 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NelfeP19426 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NelfeP19426 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NelfeP19426 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NelfeP19426 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NelfeP19426 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
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