Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rps6ka1P18653 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rps6ka1P18653 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rps6ka1P18653 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rps6ka1P18653 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rps6ka1P18653 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rps6ka1P18653 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rps6ka1P18653 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Rps6ka1P18653 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rps6ka1P18653 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Rps6ka1P18653 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Rps6ka1P18653 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rps6ka1P18653 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rps6ka1P18653 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rps6ka1P18653 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rps6ka1P18653 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Rps6ka1P18653 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rps6ka1P18653 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rps6ka1P18653 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rps6ka1P18653 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rps6ka1P18653 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rps6ka1P18653 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rps6ka1P18653 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rps6ka1P18653 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rps6ka1P18653 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rps6ka1P18653 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rps6ka1P18653 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rps6ka1P18653 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rps6ka1P18653 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rps6ka1P18653 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rps6ka1P18653 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rps6ka1P18653 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rps6ka1P18653 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rps6ka1P18653 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rps6ka1P18653 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rps6ka1P18653 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rps6ka1P18653 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rps6ka1P18653 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rps6ka1P18653 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rps6ka1P18653 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rps6ka1P18653 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rps6ka1P18653 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rps6ka1P18653 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rps6ka1P18653 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rps6ka1P18653 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rps6ka1P18653 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rps6ka1P18653 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rps6ka1P18653 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rps6ka1P18653 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rps6ka1P18653 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rps6ka1P18653 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Rps6ka1P18653 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rps6ka1P18653 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rps6ka1P18653 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rps6ka1P18653 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rps6ka1P18653 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rps6ka1P18653 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rps6ka1P18653 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rps6ka1P18653 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Rps6ka1P18653 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rps6ka1P18653 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rps6ka1P18653 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rps6ka1P18653 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rps6ka1P18653 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rps6ka1P18653 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rps6ka1P18653 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rps6ka1P18653 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rps6ka1P18653 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rps6ka1P18653 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rps6ka1P18653 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rps6ka1P18653 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rps6ka1P18653 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rps6ka1P18653 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rps6ka1P18653 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rps6ka1P18653 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rps6ka1P18653 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rps6ka1P18653 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rps6ka1P18653 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rps6ka1P18653 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rps6ka1P18653 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rps6ka1P18653 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rps6ka1P18653 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rps6ka1P18653 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rps6ka1P18653 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rps6ka1P18653 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rps6ka1P18653 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rps6ka1P18653 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rps6ka1P18653 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rps6ka1P18653 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rps6ka1P18653 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rps6ka1P18653 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rps6ka1P18653 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rps6ka1P18653 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rps6ka1P18653 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Rps6ka1P18653 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rps6ka1P18653 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rps6ka1P18653 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rps6ka1P18653 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rps6ka1P18653 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rps6ka1P18653 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms