Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptan1P16546 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptan1P16546 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sptan1P16546 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptan1P16546 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptan1P16546 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptan1P16546 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptan1P16546 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptan1P16546 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptan1P16546 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptan1P16546 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptan1P16546 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptan1P16546 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptan1P16546 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptan1P16546 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptan1P16546 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sptan1P16546 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptan1P16546 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptan1P16546 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptan1P16546 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptan1P16546 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptan1P16546 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptan1P16546 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptan1P16546 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptan1P16546 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptan1P16546 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptan1P16546 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptan1P16546 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptan1P16546 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptan1P16546 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptan1P16546 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptan1P16546 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptan1P16546 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptan1P16546 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptan1P16546 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptan1P16546 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptan1P16546 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptan1P16546 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptan1P16546 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptan1P16546 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptan1P16546 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptan1P16546 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptan1P16546 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sptan1P16546 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptan1P16546 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptan1P16546 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptan1P16546 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptan1P16546 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptan1P16546 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptan1P16546 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptan1P16546 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptan1P16546 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptan1P16546 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptan1P16546 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptan1P16546 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptan1P16546 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptan1P16546 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptan1P16546 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptan1P16546 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptan1P16546 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptan1P16546 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptan1P16546 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptan1P16546 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptan1P16546 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptan1P16546 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptan1P16546 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptan1P16546 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptan1P16546 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptan1P16546 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptan1P16546 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptan1P16546 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptan1P16546 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptan1P16546 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptan1P16546 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptan1P16546 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptan1P16546 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptan1P16546 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptan1P16546 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptan1P16546 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptan1P16546 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptan1P16546 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptan1P16546 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptan1P16546 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptan1P16546 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptan1P16546 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptan1P16546 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptan1P16546 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptan1P16546 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sptan1P16546 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptan1P16546 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptan1P16546 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptan1P16546 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptan1P16546 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptan1P16546 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptan1P16546 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sptan1P16546 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sptan1P16546 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sptan1P16546 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sptan1P16546 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sptan1P16546 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms