Protein–RNA interactions for Protein: P14431

H2-Q9, H-2 class I histocompatibility antigen, Q9 alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q9P14431 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2-Q9P14431 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2-Q9P14431 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2-Q9P14431 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2-Q9P14431 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
H2-Q9P14431 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2-Q9P14431 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2-Q9P14431 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2-Q9P14431 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
H2-Q9P14431 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2-Q9P14431 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2-Q9P14431 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2-Q9P14431 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H2-Q9P14431 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H2-Q9P14431 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H2-Q9P14431 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2-Q9P14431 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2-Q9P14431 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2-Q9P14431 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2-Q9P14431 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2-Q9P14431 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2-Q9P14431 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2-Q9P14431 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2-Q9P14431 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2-Q9P14431 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2-Q9P14431 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2-Q9P14431 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2-Q9P14431 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2-Q9P14431 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2-Q9P14431 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2-Q9P14431 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2-Q9P14431 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2-Q9P14431 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2-Q9P14431 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2-Q9P14431 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2-Q9P14431 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2-Q9P14431 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2-Q9P14431 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2-Q9P14431 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2-Q9P14431 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2-Q9P14431 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2-Q9P14431 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2-Q9P14431 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2-Q9P14431 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2-Q9P14431 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2-Q9P14431 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2-Q9P14431 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2-Q9P14431 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2-Q9P14431 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2-Q9P14431 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2-Q9P14431 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2-Q9P14431 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2-Q9P14431 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
H2-Q9P14431 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2-Q9P14431 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2-Q9P14431 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2-Q9P14431 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
H2-Q9P14431 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2-Q9P14431 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2-Q9P14431 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2-Q9P14431 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2-Q9P14431 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2-Q9P14431 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2-Q9P14431 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2-Q9P14431 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2-Q9P14431 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2-Q9P14431 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2-Q9P14431 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
H2-Q9P14431 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2-Q9P14431 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2-Q9P14431 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2-Q9P14431 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
H2-Q9P14431 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2-Q9P14431 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2-Q9P14431 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
H2-Q9P14431 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2-Q9P14431 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2-Q9P14431 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2-Q9P14431 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2-Q9P14431 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2-Q9P14431 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2-Q9P14431 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2-Q9P14431 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2-Q9P14431 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2-Q9P14431 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2-Q9P14431 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2-Q9P14431 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2-Q9P14431 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2-Q9P14431 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2-Q9P14431 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2-Q9P14431 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2-Q9P14431 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2-Q9P14431 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2-Q9P14431 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2-Q9P14431 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2-Q9P14431 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
H2-Q9P14431 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2-Q9P14431 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2-Q9P14431 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2-Q9P14431 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms