Protein–RNA interactions for Protein: P12399

Ctla2a, Protein CTLA-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2aP12399 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctla2aP12399 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctla2aP12399 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctla2aP12399 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctla2aP12399 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctla2aP12399 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctla2aP12399 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctla2aP12399 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctla2aP12399 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctla2aP12399 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctla2aP12399 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctla2aP12399 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctla2aP12399 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctla2aP12399 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctla2aP12399 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctla2aP12399 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctla2aP12399 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctla2aP12399 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctla2aP12399 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctla2aP12399 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctla2aP12399 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctla2aP12399 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctla2aP12399 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctla2aP12399 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctla2aP12399 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctla2aP12399 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctla2aP12399 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctla2aP12399 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctla2aP12399 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctla2aP12399 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctla2aP12399 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctla2aP12399 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctla2aP12399 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctla2aP12399 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctla2aP12399 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctla2aP12399 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctla2aP12399 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctla2aP12399 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctla2aP12399 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctla2aP12399 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctla2aP12399 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctla2aP12399 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctla2aP12399 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctla2aP12399 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctla2aP12399 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctla2aP12399 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctla2aP12399 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctla2aP12399 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctla2aP12399 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctla2aP12399 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctla2aP12399 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctla2aP12399 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctla2aP12399 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctla2aP12399 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctla2aP12399 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctla2aP12399 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctla2aP12399 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctla2aP12399 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctla2aP12399 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctla2aP12399 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctla2aP12399 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctla2aP12399 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctla2aP12399 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctla2aP12399 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctla2aP12399 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctla2aP12399 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctla2aP12399 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctla2aP12399 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctla2aP12399 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctla2aP12399 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctla2aP12399 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctla2aP12399 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctla2aP12399 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctla2aP12399 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctla2aP12399 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctla2aP12399 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctla2aP12399 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctla2aP12399 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctla2aP12399 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctla2aP12399 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctla2aP12399 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctla2aP12399 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctla2aP12399 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctla2aP12399 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctla2aP12399 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctla2aP12399 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctla2aP12399 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctla2aP12399 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctla2aP12399 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctla2aP12399 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctla2aP12399 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctla2aP12399 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctla2aP12399 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctla2aP12399 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctla2aP12399 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctla2aP12399 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctla2aP12399 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctla2aP12399 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctla2aP12399 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctla2aP12399 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms