Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hoxc6P10629 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Hoxc6P10629 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hoxc6P10629 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hoxc6P10629 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hoxc6P10629 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hoxc6P10629 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hoxc6P10629 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hoxc6P10629 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hoxc6P10629 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Hoxc6P10629 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hoxc6P10629 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hoxc6P10629 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Hoxc6P10629 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hoxc6P10629 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hoxc6P10629 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hoxc6P10629 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Hoxc6P10629 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hoxc6P10629 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hoxc6P10629 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hoxc6P10629 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hoxc6P10629 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hoxc6P10629 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hoxc6P10629 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Hoxc6P10629 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hoxc6P10629 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hoxc6P10629 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hoxc6P10629 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hoxc6P10629 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hoxc6P10629 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hoxc6P10629 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hoxc6P10629 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hoxc6P10629 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hoxc6P10629 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hoxc6P10629 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hoxc6P10629 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hoxc6P10629 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hoxc6P10629 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Hoxc6P10629 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hoxc6P10629 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hoxc6P10629 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hoxc6P10629 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hoxc6P10629 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hoxc6P10629 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hoxc6P10629 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Hoxc6P10629 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hoxc6P10629 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hoxc6P10629 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hoxc6P10629 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hoxc6P10629 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hoxc6P10629 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Hoxc6P10629 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hoxc6P10629 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hoxc6P10629 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hoxc6P10629 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hoxc6P10629 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hoxc6P10629 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hoxc6P10629 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Hoxc6P10629 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hoxc6P10629 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hoxc6P10629 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hoxc6P10629 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hoxc6P10629 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hoxc6P10629 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hoxc6P10629 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hoxc6P10629 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hoxc6P10629 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hoxc6P10629 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hoxc6P10629 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hoxc6P10629 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hoxc6P10629 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hoxc6P10629 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hoxc6P10629 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Hoxc6P10629 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hoxc6P10629 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hoxc6P10629 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hoxc6P10629 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hoxc6P10629 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hoxc6P10629 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hoxc6P10629 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hoxc6P10629 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hoxc6P10629 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hoxc6P10629 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hoxc6P10629 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hoxc6P10629 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hoxc6P10629 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hoxc6P10629 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hoxc6P10629 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hoxc6P10629 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hoxc6P10629 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hoxc6P10629 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hoxc6P10629 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hoxc6P10629 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hoxc6P10629 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Hoxc6P10629 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Hoxc6P10629 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hoxc6P10629 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Hoxc6P10629 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hoxc6P10629 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hoxc6P10629 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms