Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dnmt3cP0DOY1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnmt3cP0DOY1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnmt3cP0DOY1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnmt3cP0DOY1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnmt3cP0DOY1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnmt3cP0DOY1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnmt3cP0DOY1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dnmt3cP0DOY1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dnmt3cP0DOY1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnmt3cP0DOY1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnmt3cP0DOY1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnmt3cP0DOY1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnmt3cP0DOY1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnmt3cP0DOY1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnmt3cP0DOY1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnmt3cP0DOY1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnmt3cP0DOY1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnmt3cP0DOY1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnmt3cP0DOY1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnmt3cP0DOY1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnmt3cP0DOY1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnmt3cP0DOY1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnmt3cP0DOY1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnmt3cP0DOY1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnmt3cP0DOY1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnmt3cP0DOY1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnmt3cP0DOY1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnmt3cP0DOY1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnmt3cP0DOY1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnmt3cP0DOY1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnmt3cP0DOY1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnmt3cP0DOY1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnmt3cP0DOY1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnmt3cP0DOY1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnmt3cP0DOY1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnmt3cP0DOY1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnmt3cP0DOY1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnmt3cP0DOY1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnmt3cP0DOY1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnmt3cP0DOY1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnmt3cP0DOY1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnmt3cP0DOY1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnmt3cP0DOY1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Dnmt3cP0DOY1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnmt3cP0DOY1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnmt3cP0DOY1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnmt3cP0DOY1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnmt3cP0DOY1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnmt3cP0DOY1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnmt3cP0DOY1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnmt3cP0DOY1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnmt3cP0DOY1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dnmt3cP0DOY1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dnmt3cP0DOY1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dnmt3cP0DOY1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dnmt3cP0DOY1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Dnmt3cP0DOY1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dnmt3cP0DOY1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnmt3cP0DOY1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dnmt3cP0DOY1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Dnmt3cP0DOY1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dnmt3cP0DOY1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dnmt3cP0DOY1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnmt3cP0DOY1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnmt3cP0DOY1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnmt3cP0DOY1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dnmt3cP0DOY1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Dnmt3cP0DOY1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dnmt3cP0DOY1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dnmt3cP0DOY1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnmt3cP0DOY1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnmt3cP0DOY1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Dnmt3cP0DOY1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dnmt3cP0DOY1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dnmt3cP0DOY1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnmt3cP0DOY1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnmt3cP0DOY1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dnmt3cP0DOY1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dnmt3cP0DOY1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnmt3cP0DOY1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnmt3cP0DOY1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnmt3cP0DOY1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnmt3cP0DOY1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dnmt3cP0DOY1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dnmt3cP0DOY1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Dnmt3cP0DOY1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dnmt3cP0DOY1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dnmt3cP0DOY1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dnmt3cP0DOY1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dnmt3cP0DOY1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dnmt3cP0DOY1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dnmt3cP0DOY1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Dnmt3cP0DOY1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dnmt3cP0DOY1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dnmt3cP0DOY1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dnmt3cP0DOY1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms