Protein–RNA interactions for Protein: P08883

Gzmf, Granzyme F, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmfP08883 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GzmfP08883 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GzmfP08883 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GzmfP08883 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GzmfP08883 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GzmfP08883 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GzmfP08883 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GzmfP08883 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GzmfP08883 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GzmfP08883 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GzmfP08883 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GzmfP08883 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GzmfP08883 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GzmfP08883 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GzmfP08883 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GzmfP08883 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GzmfP08883 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GzmfP08883 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GzmfP08883 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GzmfP08883 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GzmfP08883 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GzmfP08883 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GzmfP08883 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GzmfP08883 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GzmfP08883 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GzmfP08883 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GzmfP08883 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GzmfP08883 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GzmfP08883 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GzmfP08883 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GzmfP08883 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GzmfP08883 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GzmfP08883 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GzmfP08883 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GzmfP08883 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GzmfP08883 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GzmfP08883 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GzmfP08883 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GzmfP08883 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GzmfP08883 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GzmfP08883 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GzmfP08883 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GzmfP08883 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GzmfP08883 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GzmfP08883 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GzmfP08883 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GzmfP08883 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GzmfP08883 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GzmfP08883 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GzmfP08883 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GzmfP08883 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GzmfP08883 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GzmfP08883 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GzmfP08883 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GzmfP08883 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GzmfP08883 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GzmfP08883 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GzmfP08883 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GzmfP08883 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GzmfP08883 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GzmfP08883 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GzmfP08883 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GzmfP08883 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GzmfP08883 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GzmfP08883 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GzmfP08883 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GzmfP08883 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GzmfP08883 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GzmfP08883 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GzmfP08883 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GzmfP08883 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
GzmfP08883 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GzmfP08883 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GzmfP08883 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GzmfP08883 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GzmfP08883 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GzmfP08883 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GzmfP08883 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GzmfP08883 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GzmfP08883 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GzmfP08883 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GzmfP08883 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GzmfP08883 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GzmfP08883 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GzmfP08883 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GzmfP08883 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GzmfP08883 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GzmfP08883 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GzmfP08883 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GzmfP08883 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GzmfP08883 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GzmfP08883 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GzmfP08883 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GzmfP08883 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GzmfP08883 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GzmfP08883 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GzmfP08883 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GzmfP08883 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GzmfP08883 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GzmfP08883 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms