Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ifna4P07351 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ifna4P07351 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ifna4P07351 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ifna4P07351 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ifna4P07351 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ifna4P07351 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ifna4P07351 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ifna4P07351 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifna4P07351 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifna4P07351 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifna4P07351 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifna4P07351 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifna4P07351 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifna4P07351 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifna4P07351 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifna4P07351 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifna4P07351 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifna4P07351 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifna4P07351 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifna4P07351 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifna4P07351 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifna4P07351 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifna4P07351 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifna4P07351 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifna4P07351 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifna4P07351 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifna4P07351 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifna4P07351 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ifna4P07351 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifna4P07351 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifna4P07351 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifna4P07351 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifna4P07351 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifna4P07351 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifna4P07351 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifna4P07351 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifna4P07351 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifna4P07351 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifna4P07351 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifna4P07351 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifna4P07351 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifna4P07351 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifna4P07351 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifna4P07351 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifna4P07351 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifna4P07351 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifna4P07351 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifna4P07351 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifna4P07351 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifna4P07351 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifna4P07351 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifna4P07351 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifna4P07351 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifna4P07351 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifna4P07351 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ifna4P07351 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ifna4P07351 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ifna4P07351 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ifna4P07351 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifna4P07351 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifna4P07351 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifna4P07351 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifna4P07351 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifna4P07351 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifna4P07351 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifna4P07351 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifna4P07351 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifna4P07351 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifna4P07351 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifna4P07351 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifna4P07351 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifna4P07351 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ifna4P07351 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifna4P07351 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifna4P07351 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifna4P07351 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifna4P07351 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ifna4P07351 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ifna4P07351 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ifna4P07351 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifna4P07351 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifna4P07351 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifna4P07351 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifna4P07351 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifna4P07351 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifna4P07351 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifna4P07351 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifna4P07351 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifna4P07351 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifna4P07351 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifna4P07351 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifna4P07351 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifna4P07351 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifna4P07351 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifna4P07351 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifna4P07351 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifna4P07351 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifna4P07351 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifna4P07351 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103 ms