Protein–RNA interactions for Protein: P06683

C9, Complement component C9, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P06683 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9P06683 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C9P06683 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9P06683 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9P06683 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9P06683 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9P06683 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9P06683 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9P06683 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9P06683 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9P06683 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9P06683 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9P06683 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9P06683 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9P06683 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9P06683 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9P06683 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9P06683 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9P06683 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9P06683 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9P06683 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9P06683 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9P06683 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9P06683 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9P06683 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9P06683 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9P06683 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9P06683 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9P06683 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9P06683 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9P06683 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9P06683 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9P06683 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9P06683 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9P06683 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9P06683 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9P06683 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9P06683 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9P06683 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9P06683 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9P06683 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9P06683 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9P06683 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9P06683 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9P06683 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9P06683 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9P06683 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9P06683 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9P06683 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9P06683 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C9P06683 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9P06683 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9P06683 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9P06683 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9P06683 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9P06683 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9P06683 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9P06683 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9P06683 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9P06683 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9P06683 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C9P06683 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C9P06683 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9P06683 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9P06683 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C9P06683 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9P06683 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9P06683 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9P06683 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9P06683 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9P06683 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9P06683 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9P06683 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9P06683 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9P06683 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9P06683 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9P06683 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9P06683 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9P06683 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9P06683 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C9P06683 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9P06683 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9P06683 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9P06683 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9P06683 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9P06683 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9P06683 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9P06683 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9P06683 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9P06683 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9P06683 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9P06683 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9P06683 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9P06683 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9P06683 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9P06683 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9P06683 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9P06683 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9P06683 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9P06683 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms