Protein–RNA interactions for Protein: P04919

Slc4a1, Band 3 anion transport protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a1P04919 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Slc4a1P04919 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Slc4a1P04919 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Slc4a1P04919 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Slc4a1P04919 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Slc4a1P04919 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
Slc4a1P04919 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Slc4a1P04919 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Slc4a1P04919 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Slc4a1P04919 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Slc4a1P04919 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Slc4a1P04919 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Slc4a1P04919 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Slc4a1P04919 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Slc4a1P04919 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Slc4a1P04919 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Slc4a1P04919 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Slc4a1P04919 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Slc4a1P04919 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Slc4a1P04919 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Slc4a1P04919 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Slc4a1P04919 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Slc4a1P04919 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Slc4a1P04919 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Slc4a1P04919 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Slc4a1P04919 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Slc4a1P04919 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Slc4a1P04919 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Slc4a1P04919 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Slc4a1P04919 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Slc4a1P04919 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Slc4a1P04919 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Slc4a1P04919 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Slc4a1P04919 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Slc4a1P04919 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Slc4a1P04919 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Slc4a1P04919 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Slc4a1P04919 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Slc4a1P04919 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Slc4a1P04919 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Slc4a1P04919 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Slc4a1P04919 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Slc4a1P04919 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Slc4a1P04919 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Slc4a1P04919 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Slc4a1P04919 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Slc4a1P04919 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Slc4a1P04919 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Slc4a1P04919 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Slc4a1P04919 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Slc4a1P04919 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Slc4a1P04919 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Slc4a1P04919 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Slc4a1P04919 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Slc4a1P04919 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Slc4a1P04919 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Slc4a1P04919 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Slc4a1P04919 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Slc4a1P04919 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Slc4a1P04919 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Slc4a1P04919 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Slc4a1P04919 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Slc4a1P04919 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Slc4a1P04919 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Slc4a1P04919 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Slc4a1P04919 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Slc4a1P04919 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Slc4a1P04919 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Slc4a1P04919 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Slc4a1P04919 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Slc4a1P04919 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Slc4a1P04919 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Slc4a1P04919 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Slc4a1P04919 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Slc4a1P04919 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Slc4a1P04919 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Slc4a1P04919 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Slc4a1P04919 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Slc4a1P04919 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Slc4a1P04919 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Slc4a1P04919 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Slc4a1P04919 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Slc4a1P04919 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Slc4a1P04919 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Slc4a1P04919 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Slc4a1P04919 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Slc4a1P04919 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Slc4a1P04919 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Slc4a1P04919 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Slc4a1P04919 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Slc4a1P04919 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Slc4a1P04919 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Slc4a1P04919 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Slc4a1P04919 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Slc4a1P04919 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Slc4a1P04919 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Slc4a1P04919 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Slc4a1P04919 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Slc4a1P04919 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Slc4a1P04919 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.3 ms