Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tk1P04184 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tk1P04184 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tk1P04184 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tk1P04184 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tk1P04184 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tk1P04184 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tk1P04184 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tk1P04184 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tk1P04184 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tk1P04184 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tk1P04184 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tk1P04184 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tk1P04184 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tk1P04184 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tk1P04184 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tk1P04184 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tk1P04184 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tk1P04184 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tk1P04184 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tk1P04184 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tk1P04184 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tk1P04184 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tk1P04184 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tk1P04184 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tk1P04184 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tk1P04184 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tk1P04184 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tk1P04184 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tk1P04184 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tk1P04184 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tk1P04184 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tk1P04184 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tk1P04184 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tk1P04184 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tk1P04184 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tk1P04184 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tk1P04184 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tk1P04184 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tk1P04184 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tk1P04184 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tk1P04184 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tk1P04184 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tk1P04184 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tk1P04184 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tk1P04184 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tk1P04184 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tk1P04184 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tk1P04184 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tk1P04184 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tk1P04184 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tk1P04184 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tk1P04184 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tk1P04184 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tk1P04184 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tk1P04184 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tk1P04184 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tk1P04184 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tk1P04184 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tk1P04184 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tk1P04184 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tk1P04184 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tk1P04184 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tk1P04184 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tk1P04184 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tk1P04184 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tk1P04184 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tk1P04184 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tk1P04184 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tk1P04184 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tk1P04184 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tk1P04184 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tk1P04184 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tk1P04184 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tk1P04184 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tk1P04184 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tk1P04184 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tk1P04184 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tk1P04184 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tk1P04184 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tk1P04184 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tk1P04184 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tk1P04184 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tk1P04184 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tk1P04184 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tk1P04184 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tk1P04184 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tk1P04184 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tk1P04184 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tk1P04184 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tk1P04184 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tk1P04184 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tk1P04184 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tk1P04184 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tk1P04184 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tk1P04184 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tk1P04184 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tk1P04184 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tk1P04184 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tk1P04184 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms