Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01649 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01649 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01649 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01649 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01649 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01649 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01649 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01649 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01649 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01649 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
P01649 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
P01649 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01649 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01649 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01649 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01649 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01649 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01649 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01649 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01649 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01649 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01649 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01649 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.33■■□□□ 1
P01649 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01649 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01649 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01649 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01649 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01649 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P01649 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01649 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
P01649 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
P01649 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01649 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01649 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01649 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01649 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01649 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01649 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01649 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01649 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
P01649 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01649 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01649 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01649 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01649 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01649 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01649 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01649 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01649 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
P01649 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
P01649 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01649 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01649 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01649 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01649 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
P01649 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
P01649 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01649 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01649 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01649 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01649 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01649 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01649 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01649 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01649 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
P01649 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
P01649 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01649 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01649 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01649 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01649 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01649 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01649 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01649 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01649 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01649 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01649 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01649 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01649 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01649 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01649 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01649 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01649 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01649 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01649 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P01649 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P01649 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P01649 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01649 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01649 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
P01649 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
P01649 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
P01649 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
P01649 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P01649 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P01649 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
P01649 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
P01649 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms