Protein–RNA interactions for Protein: P01637

Ig kappa chain V-V region T1, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01637 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P01637 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P01637 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P01637 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P01637 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P01637 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P01637 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P01637 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P01637 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01637 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01637 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P01637 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P01637 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
P01637 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P01637 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
P01637 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
P01637 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01637 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P01637 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P01637 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P01637 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P01637 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P01637 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
P01637 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P01637 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P01637 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01637 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01637 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01637 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01637 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01637 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01637 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01637 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01637 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
P01637 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01637 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01637 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
P01637 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01637 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
P01637 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01637 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01637 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01637 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
P01637 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01637 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01637 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01637 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01637 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
P01637 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01637 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01637 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01637 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01637 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
P01637 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01637 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01637 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01637 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01637 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01637 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01637 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01637 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01637 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01637 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01637 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
P01637 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
P01637 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
P01637 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01637 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01637 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01637 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01637 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01637 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
P01637 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
P01637 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01637 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01637 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01637 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01637 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01637 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01637 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01637 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01637 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01637 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01637 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01637 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01637 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01637 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01637 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01637 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01637 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01637 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01637 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01637 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01637 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01637 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01637 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01637 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01637 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01637 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01637 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms