Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp8O89110 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Casp8O89110 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Casp8O89110 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Casp8O89110 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Casp8O89110 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Casp8O89110 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Casp8O89110 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casp8O89110 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casp8O89110 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casp8O89110 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casp8O89110 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casp8O89110 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Casp8O89110 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Casp8O89110 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Casp8O89110 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casp8O89110 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casp8O89110 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casp8O89110 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casp8O89110 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casp8O89110 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Casp8O89110 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casp8O89110 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Casp8O89110 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Casp8O89110 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Casp8O89110 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Casp8O89110 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Casp8O89110 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Casp8O89110 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Casp8O89110 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Casp8O89110 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Casp8O89110 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casp8O89110 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Casp8O89110 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casp8O89110 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Casp8O89110 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Casp8O89110 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Casp8O89110 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Casp8O89110 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casp8O89110 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casp8O89110 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casp8O89110 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casp8O89110 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casp8O89110 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Casp8O89110 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Casp8O89110 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Casp8O89110 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Casp8O89110 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Casp8O89110 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Casp8O89110 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Casp8O89110 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Casp8O89110 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Casp8O89110 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casp8O89110 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casp8O89110 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casp8O89110 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Casp8O89110 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Casp8O89110 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Casp8O89110 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casp8O89110 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casp8O89110 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Casp8O89110 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Casp8O89110 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Casp8O89110 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Casp8O89110 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Casp8O89110 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Casp8O89110 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Casp8O89110 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Casp8O89110 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Casp8O89110 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Casp8O89110 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Casp8O89110 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Casp8O89110 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Casp8O89110 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Casp8O89110 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Casp8O89110 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Casp8O89110 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Casp8O89110 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Casp8O89110 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Casp8O89110 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Casp8O89110 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Casp8O89110 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Casp8O89110 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Casp8O89110 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casp8O89110 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casp8O89110 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casp8O89110 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casp8O89110 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casp8O89110 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casp8O89110 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casp8O89110 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casp8O89110 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casp8O89110 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casp8O89110 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casp8O89110 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casp8O89110 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casp8O89110 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casp8O89110 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casp8O89110 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casp8O89110 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms