Protein–RNA interactions for Protein: O89032

Sh3pxd2a, SH3 and PX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2aO89032 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3pxd2aO89032 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3pxd2aO89032 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3pxd2aO89032 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh3pxd2aO89032 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh3pxd2aO89032 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3pxd2aO89032 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3pxd2aO89032 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3pxd2aO89032 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3pxd2aO89032 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3pxd2aO89032 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3pxd2aO89032 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3pxd2aO89032 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3pxd2aO89032 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3pxd2aO89032 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3pxd2aO89032 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3pxd2aO89032 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3pxd2aO89032 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3pxd2aO89032 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3pxd2aO89032 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3pxd2aO89032 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3pxd2aO89032 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3pxd2aO89032 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3pxd2aO89032 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3pxd2aO89032 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3pxd2aO89032 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3pxd2aO89032 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3pxd2aO89032 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3pxd2aO89032 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3pxd2aO89032 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3pxd2aO89032 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3pxd2aO89032 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3pxd2aO89032 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3pxd2aO89032 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3pxd2aO89032 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3pxd2aO89032 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3pxd2aO89032 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3pxd2aO89032 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh3pxd2aO89032 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh3pxd2aO89032 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3pxd2aO89032 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3pxd2aO89032 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3pxd2aO89032 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3pxd2aO89032 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3pxd2aO89032 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3pxd2aO89032 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3pxd2aO89032 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3pxd2aO89032 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3pxd2aO89032 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3pxd2aO89032 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3pxd2aO89032 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3pxd2aO89032 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sh3pxd2aO89032 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3pxd2aO89032 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3pxd2aO89032 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3pxd2aO89032 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3pxd2aO89032 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh3pxd2aO89032 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh3pxd2aO89032 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3pxd2aO89032 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3pxd2aO89032 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3pxd2aO89032 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3pxd2aO89032 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3pxd2aO89032 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3pxd2aO89032 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3pxd2aO89032 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3pxd2aO89032 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3pxd2aO89032 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3pxd2aO89032 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3pxd2aO89032 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3pxd2aO89032 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3pxd2aO89032 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3pxd2aO89032 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3pxd2aO89032 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3pxd2aO89032 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3pxd2aO89032 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3pxd2aO89032 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3pxd2aO89032 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3pxd2aO89032 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3pxd2aO89032 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3pxd2aO89032 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3pxd2aO89032 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3pxd2aO89032 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3pxd2aO89032 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3pxd2aO89032 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3pxd2aO89032 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3pxd2aO89032 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3pxd2aO89032 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3pxd2aO89032 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3pxd2aO89032 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh3pxd2aO89032 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh3pxd2aO89032 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sh3pxd2aO89032 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sh3pxd2aO89032 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sh3pxd2aO89032 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sh3pxd2aO89032 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3pxd2aO89032 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3pxd2aO89032 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sh3pxd2aO89032 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3pxd2aO89032 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms