Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnk4O88454 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnk4O88454 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnk4O88454 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcnk4O88454 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcnk4O88454 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcnk4O88454 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnk4O88454 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnk4O88454 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kcnk4O88454 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnk4O88454 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcnk4O88454 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcnk4O88454 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcnk4O88454 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcnk4O88454 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnk4O88454 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnk4O88454 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnk4O88454 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnk4O88454 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kcnk4O88454 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kcnk4O88454 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kcnk4O88454 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kcnk4O88454 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnk4O88454 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnk4O88454 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnk4O88454 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnk4O88454 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnk4O88454 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnk4O88454 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnk4O88454 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnk4O88454 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnk4O88454 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnk4O88454 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnk4O88454 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnk4O88454 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnk4O88454 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnk4O88454 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnk4O88454 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnk4O88454 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnk4O88454 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnk4O88454 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnk4O88454 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcnk4O88454 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnk4O88454 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnk4O88454 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcnk4O88454 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcnk4O88454 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnk4O88454 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnk4O88454 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnk4O88454 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnk4O88454 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnk4O88454 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnk4O88454 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnk4O88454 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnk4O88454 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnk4O88454 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnk4O88454 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnk4O88454 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnk4O88454 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnk4O88454 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnk4O88454 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnk4O88454 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnk4O88454 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnk4O88454 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnk4O88454 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnk4O88454 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnk4O88454 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnk4O88454 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnk4O88454 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnk4O88454 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnk4O88454 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnk4O88454 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnk4O88454 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnk4O88454 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnk4O88454 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnk4O88454 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnk4O88454 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnk4O88454 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnk4O88454 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnk4O88454 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnk4O88454 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnk4O88454 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnk4O88454 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnk4O88454 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcnk4O88454 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms