Protein–RNA interactions for Protein: O88351

Ikbkb, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IkbkbO88351 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IkbkbO88351 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IkbkbO88351 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IkbkbO88351 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IkbkbO88351 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IkbkbO88351 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IkbkbO88351 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IkbkbO88351 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IkbkbO88351 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IkbkbO88351 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IkbkbO88351 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IkbkbO88351 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IkbkbO88351 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IkbkbO88351 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IkbkbO88351 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IkbkbO88351 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
IkbkbO88351 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IkbkbO88351 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IkbkbO88351 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
IkbkbO88351 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IkbkbO88351 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
IkbkbO88351 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IkbkbO88351 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IkbkbO88351 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IkbkbO88351 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
IkbkbO88351 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IkbkbO88351 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IkbkbO88351 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IkbkbO88351 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IkbkbO88351 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IkbkbO88351 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IkbkbO88351 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IkbkbO88351 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IkbkbO88351 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IkbkbO88351 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
IkbkbO88351 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IkbkbO88351 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IkbkbO88351 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IkbkbO88351 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IkbkbO88351 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IkbkbO88351 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IkbkbO88351 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IkbkbO88351 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
IkbkbO88351 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IkbkbO88351 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IkbkbO88351 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IkbkbO88351 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IkbkbO88351 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IkbkbO88351 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
IkbkbO88351 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IkbkbO88351 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IkbkbO88351 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IkbkbO88351 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IkbkbO88351 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IkbkbO88351 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IkbkbO88351 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IkbkbO88351 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IkbkbO88351 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IkbkbO88351 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IkbkbO88351 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IkbkbO88351 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IkbkbO88351 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IkbkbO88351 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IkbkbO88351 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IkbkbO88351 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IkbkbO88351 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IkbkbO88351 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IkbkbO88351 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.54■■■□□ 2
IkbkbO88351 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.54■■■□□ 2
IkbkbO88351 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IkbkbO88351 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IkbkbO88351 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IkbkbO88351 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IkbkbO88351 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IkbkbO88351 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IkbkbO88351 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IkbkbO88351 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IkbkbO88351 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IkbkbO88351 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
IkbkbO88351 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IkbkbO88351 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IkbkbO88351 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IkbkbO88351 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IkbkbO88351 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IkbkbO88351 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
IkbkbO88351 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IkbkbO88351 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IkbkbO88351 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IkbkbO88351 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IkbkbO88351 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IkbkbO88351 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IkbkbO88351 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IkbkbO88351 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IkbkbO88351 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IkbkbO88351 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IkbkbO88351 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IkbkbO88351 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IkbkbO88351 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IkbkbO88351 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IkbkbO88351 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms