Protein–RNA interactions for Protein: O88338

Cdh16, Cadherin-16, mousemouse

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh16O88338 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh16O88338 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdh16O88338 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdh16O88338 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdh16O88338 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdh16O88338 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdh16O88338 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdh16O88338 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdh16O88338 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdh16O88338 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdh16O88338 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdh16O88338 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdh16O88338 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdh16O88338 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdh16O88338 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdh16O88338 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdh16O88338 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdh16O88338 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdh16O88338 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdh16O88338 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdh16O88338 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdh16O88338 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdh16O88338 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh16O88338 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh16O88338 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh16O88338 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh16O88338 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh16O88338 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh16O88338 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdh16O88338 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdh16O88338 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cdh16O88338 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdh16O88338 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdh16O88338 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdh16O88338 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdh16O88338 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdh16O88338 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdh16O88338 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdh16O88338 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdh16O88338 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdh16O88338 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdh16O88338 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdh16O88338 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdh16O88338 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdh16O88338 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdh16O88338 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdh16O88338 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdh16O88338 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdh16O88338 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdh16O88338 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdh16O88338 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdh16O88338 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdh16O88338 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdh16O88338 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdh16O88338 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdh16O88338 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdh16O88338 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdh16O88338 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdh16O88338 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdh16O88338 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdh16O88338 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdh16O88338 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdh16O88338 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdh16O88338 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdh16O88338 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdh16O88338 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh16O88338 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh16O88338 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh16O88338 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh16O88338 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh16O88338 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh16O88338 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdh16O88338 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdh16O88338 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdh16O88338 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdh16O88338 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdh16O88338 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdh16O88338 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh16O88338 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdh16O88338 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdh16O88338 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdh16O88338 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdh16O88338 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdh16O88338 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdh16O88338 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdh16O88338 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdh16O88338 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh16O88338 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh16O88338 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh16O88338 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdh16O88338 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdh16O88338 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdh16O88338 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdh16O88338 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdh16O88338 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh16O88338 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh16O88338 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh16O88338 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh16O88338 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdh16O88338 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms