Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Xirp1O70373 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Xirp1O70373 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Xirp1O70373 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Xirp1O70373 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Xirp1O70373 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Xirp1O70373 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Xirp1O70373 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Xirp1O70373 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Xirp1O70373 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Xirp1O70373 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Xirp1O70373 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Xirp1O70373 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Xirp1O70373 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Xirp1O70373 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Xirp1O70373 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Xirp1O70373 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Xirp1O70373 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Xirp1O70373 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Xirp1O70373 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Xirp1O70373 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Xirp1O70373 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Xirp1O70373 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Xirp1O70373 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Xirp1O70373 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Xirp1O70373 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Xirp1O70373 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Xirp1O70373 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Xirp1O70373 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Xirp1O70373 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Xirp1O70373 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Xirp1O70373 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Xirp1O70373 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Xirp1O70373 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Xirp1O70373 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Xirp1O70373 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Xirp1O70373 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Xirp1O70373 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Xirp1O70373 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Xirp1O70373 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Xirp1O70373 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Xirp1O70373 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Xirp1O70373 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Xirp1O70373 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Xirp1O70373 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Xirp1O70373 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Xirp1O70373 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Xirp1O70373 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Xirp1O70373 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Xirp1O70373 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Xirp1O70373 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Xirp1O70373 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Xirp1O70373 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Xirp1O70373 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Xirp1O70373 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Xirp1O70373 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Xirp1O70373 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Xirp1O70373 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Xirp1O70373 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Xirp1O70373 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Xirp1O70373 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Xirp1O70373 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Xirp1O70373 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Xirp1O70373 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Xirp1O70373 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Xirp1O70373 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Xirp1O70373 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Xirp1O70373 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Xirp1O70373 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Xirp1O70373 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Xirp1O70373 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Xirp1O70373 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Xirp1O70373 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Xirp1O70373 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Xirp1O70373 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Xirp1O70373 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Xirp1O70373 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Xirp1O70373 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Xirp1O70373 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Xirp1O70373 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Xirp1O70373 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Xirp1O70373 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Xirp1O70373 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Xirp1O70373 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Xirp1O70373 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Xirp1O70373 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Xirp1O70373 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Xirp1O70373 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Xirp1O70373 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Xirp1O70373 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Xirp1O70373 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Xirp1O70373 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Xirp1O70373 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Xirp1O70373 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Xirp1O70373 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Xirp1O70373 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Xirp1O70373 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Xirp1O70373 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Xirp1O70373 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Xirp1O70373 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms