Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl35aO55142 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl35aO55142 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl35aO55142 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl35aO55142 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl35aO55142 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl35aO55142 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl35aO55142 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl35aO55142 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl35aO55142 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl35aO55142 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl35aO55142 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl35aO55142 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl35aO55142 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl35aO55142 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl35aO55142 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl35aO55142 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl35aO55142 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl35aO55142 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl35aO55142 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl35aO55142 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl35aO55142 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl35aO55142 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpl35aO55142 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpl35aO55142 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpl35aO55142 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpl35aO55142 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpl35aO55142 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl35aO55142 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl35aO55142 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl35aO55142 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl35aO55142 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl35aO55142 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl35aO55142 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpl35aO55142 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl35aO55142 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl35aO55142 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl35aO55142 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl35aO55142 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl35aO55142 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl35aO55142 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl35aO55142 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl35aO55142 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl35aO55142 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl35aO55142 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl35aO55142 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl35aO55142 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl35aO55142 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl35aO55142 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl35aO55142 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl35aO55142 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl35aO55142 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl35aO55142 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl35aO55142 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl35aO55142 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl35aO55142 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl35aO55142 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl35aO55142 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl35aO55142 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl35aO55142 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl35aO55142 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl35aO55142 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl35aO55142 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl35aO55142 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl35aO55142 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl35aO55142 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl35aO55142 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl35aO55142 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl35aO55142 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl35aO55142 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl35aO55142 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl35aO55142 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl35aO55142 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl35aO55142 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl35aO55142 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl35aO55142 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl35aO55142 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl35aO55142 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl35aO55142 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl35aO55142 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl35aO55142 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl35aO55142 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl35aO55142 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl35aO55142 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl35aO55142 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl35aO55142 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl35aO55142 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl35aO55142 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl35aO55142 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl35aO55142 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl35aO55142 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl35aO55142 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl35aO55142 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl35aO55142 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl35aO55142 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl35aO55142 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl35aO55142 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl35aO55142 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl35aO55142 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl35aO55142 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms