Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Eif6O55135 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Eif6O55135 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Eif6O55135 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Eif6O55135 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Eif6O55135 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Eif6O55135 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Eif6O55135 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Eif6O55135 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Eif6O55135 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Eif6O55135 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Eif6O55135 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Eif6O55135 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Eif6O55135 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Eif6O55135 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Eif6O55135 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Eif6O55135 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Eif6O55135 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Eif6O55135 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Eif6O55135 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Eif6O55135 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Eif6O55135 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Eif6O55135 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Eif6O55135 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Eif6O55135 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Eif6O55135 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Eif6O55135 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Eif6O55135 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Eif6O55135 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Eif6O55135 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Eif6O55135 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Eif6O55135 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Eif6O55135 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Eif6O55135 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Eif6O55135 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Eif6O55135 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Eif6O55135 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Eif6O55135 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Eif6O55135 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Eif6O55135 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Eif6O55135 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Eif6O55135 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Eif6O55135 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Eif6O55135 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Eif6O55135 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Eif6O55135 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Eif6O55135 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Eif6O55135 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Eif6O55135 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Eif6O55135 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Eif6O55135 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Eif6O55135 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Eif6O55135 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Eif6O55135 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Eif6O55135 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Eif6O55135 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Eif6O55135 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Eif6O55135 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Eif6O55135 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Eif6O55135 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Eif6O55135 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Eif6O55135 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Eif6O55135 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Eif6O55135 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Eif6O55135 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Eif6O55135 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Eif6O55135 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Eif6O55135 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Eif6O55135 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Eif6O55135 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Eif6O55135 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Eif6O55135 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Eif6O55135 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Eif6O55135 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Eif6O55135 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Eif6O55135 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Eif6O55135 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Eif6O55135 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Eif6O55135 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Eif6O55135 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Eif6O55135 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Eif6O55135 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Eif6O55135 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Eif6O55135 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Eif6O55135 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Eif6O55135 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Eif6O55135 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Eif6O55135 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Eif6O55135 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Eif6O55135 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Eif6O55135 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Eif6O55135 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Eif6O55135 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Eif6O55135 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Eif6O55135 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Eif6O55135 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Eif6O55135 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Eif6O55135 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Eif6O55135 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Eif6O55135 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms