Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bnc1O35914 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bnc1O35914 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bnc1O35914 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bnc1O35914 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bnc1O35914 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bnc1O35914 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bnc1O35914 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bnc1O35914 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bnc1O35914 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bnc1O35914 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bnc1O35914 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bnc1O35914 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bnc1O35914 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bnc1O35914 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bnc1O35914 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bnc1O35914 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bnc1O35914 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bnc1O35914 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bnc1O35914 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bnc1O35914 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bnc1O35914 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bnc1O35914 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Bnc1O35914 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bnc1O35914 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bnc1O35914 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bnc1O35914 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bnc1O35914 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bnc1O35914 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Bnc1O35914 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bnc1O35914 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bnc1O35914 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bnc1O35914 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bnc1O35914 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bnc1O35914 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bnc1O35914 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bnc1O35914 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bnc1O35914 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bnc1O35914 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bnc1O35914 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bnc1O35914 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bnc1O35914 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bnc1O35914 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Bnc1O35914 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Bnc1O35914 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Bnc1O35914 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Bnc1O35914 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bnc1O35914 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bnc1O35914 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bnc1O35914 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bnc1O35914 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bnc1O35914 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bnc1O35914 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bnc1O35914 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Bnc1O35914 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bnc1O35914 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bnc1O35914 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bnc1O35914 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bnc1O35914 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bnc1O35914 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bnc1O35914 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bnc1O35914 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bnc1O35914 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bnc1O35914 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Bnc1O35914 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bnc1O35914 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bnc1O35914 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Bnc1O35914 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Bnc1O35914 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Bnc1O35914 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bnc1O35914 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bnc1O35914 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bnc1O35914 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bnc1O35914 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bnc1O35914 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bnc1O35914 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bnc1O35914 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bnc1O35914 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bnc1O35914 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bnc1O35914 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bnc1O35914 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bnc1O35914 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Bnc1O35914 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bnc1O35914 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bnc1O35914 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bnc1O35914 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Bnc1O35914 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Bnc1O35914 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bnc1O35914 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bnc1O35914 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bnc1O35914 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bnc1O35914 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bnc1O35914 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bnc1O35914 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bnc1O35914 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bnc1O35914 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bnc1O35914 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Bnc1O35914 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bnc1O35914 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bnc1O35914 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms