Protein–RNA interactions for Protein: O35709

Enc1, Ectoderm-neural cortex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Enc1O35709 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Enc1O35709 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Enc1O35709 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Enc1O35709 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Enc1O35709 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Enc1O35709 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Enc1O35709 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Enc1O35709 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Enc1O35709 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Enc1O35709 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Enc1O35709 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Enc1O35709 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Enc1O35709 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Enc1O35709 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Enc1O35709 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Enc1O35709 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Enc1O35709 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Enc1O35709 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Enc1O35709 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Enc1O35709 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Enc1O35709 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Enc1O35709 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Enc1O35709 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Enc1O35709 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Enc1O35709 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Enc1O35709 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Enc1O35709 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Enc1O35709 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Enc1O35709 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Enc1O35709 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Enc1O35709 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Enc1O35709 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Enc1O35709 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Enc1O35709 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Enc1O35709 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Enc1O35709 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Enc1O35709 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Enc1O35709 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Enc1O35709 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Enc1O35709 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Enc1O35709 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Enc1O35709 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Enc1O35709 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Enc1O35709 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Enc1O35709 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Enc1O35709 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Enc1O35709 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Enc1O35709 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Enc1O35709 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Enc1O35709 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Enc1O35709 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Enc1O35709 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Enc1O35709 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Enc1O35709 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Enc1O35709 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Enc1O35709 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Enc1O35709 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Enc1O35709 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Enc1O35709 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Enc1O35709 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Enc1O35709 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Enc1O35709 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Enc1O35709 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Enc1O35709 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Enc1O35709 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Enc1O35709 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Enc1O35709 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Enc1O35709 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Enc1O35709 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Enc1O35709 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Enc1O35709 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Enc1O35709 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Enc1O35709 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Enc1O35709 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Enc1O35709 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Enc1O35709 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Enc1O35709 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Enc1O35709 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Enc1O35709 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Enc1O35709 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Enc1O35709 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Enc1O35709 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Enc1O35709 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Enc1O35709 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Enc1O35709 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Enc1O35709 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Enc1O35709 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Enc1O35709 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Enc1O35709 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Enc1O35709 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Enc1O35709 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Enc1O35709 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Enc1O35709 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Enc1O35709 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Enc1O35709 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Enc1O35709 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Enc1O35709 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Enc1O35709 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Enc1O35709 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Enc1O35709 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms