Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Opn1mwO35599 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Opn1mwO35599 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Opn1mwO35599 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Opn1mwO35599 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Opn1mwO35599 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Opn1mwO35599 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Opn1mwO35599 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Opn1mwO35599 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Opn1mwO35599 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Opn1mwO35599 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Opn1mwO35599 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Opn1mwO35599 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Opn1mwO35599 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Opn1mwO35599 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Opn1mwO35599 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Opn1mwO35599 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Opn1mwO35599 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Opn1mwO35599 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Opn1mwO35599 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Opn1mwO35599 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Opn1mwO35599 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Opn1mwO35599 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Opn1mwO35599 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Opn1mwO35599 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Opn1mwO35599 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Opn1mwO35599 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Opn1mwO35599 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Opn1mwO35599 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Opn1mwO35599 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Opn1mwO35599 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Opn1mwO35599 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Opn1mwO35599 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Opn1mwO35599 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Opn1mwO35599 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Opn1mwO35599 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Opn1mwO35599 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Opn1mwO35599 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Opn1mwO35599 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Opn1mwO35599 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Opn1mwO35599 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Opn1mwO35599 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Opn1mwO35599 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Opn1mwO35599 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Opn1mwO35599 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Opn1mwO35599 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Opn1mwO35599 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Opn1mwO35599 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Opn1mwO35599 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Opn1mwO35599 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Opn1mwO35599 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Opn1mwO35599 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Opn1mwO35599 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Opn1mwO35599 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Opn1mwO35599 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Opn1mwO35599 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Opn1mwO35599 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Opn1mwO35599 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Opn1mwO35599 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Opn1mwO35599 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Opn1mwO35599 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Opn1mwO35599 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Opn1mwO35599 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Opn1mwO35599 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Opn1mwO35599 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Opn1mwO35599 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Opn1mwO35599 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Opn1mwO35599 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Opn1mwO35599 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Opn1mwO35599 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Opn1mwO35599 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Opn1mwO35599 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Opn1mwO35599 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Opn1mwO35599 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Opn1mwO35599 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Opn1mwO35599 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Opn1mwO35599 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Opn1mwO35599 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Opn1mwO35599 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Opn1mwO35599 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Opn1mwO35599 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Opn1mwO35599 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Opn1mwO35599 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Opn1mwO35599 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Opn1mwO35599 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Opn1mwO35599 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Opn1mwO35599 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Opn1mwO35599 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Opn1mwO35599 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Opn1mwO35599 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Opn1mwO35599 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Opn1mwO35599 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Opn1mwO35599 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Opn1mwO35599 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Opn1mwO35599 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Opn1mwO35599 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Opn1mwO35599 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Opn1mwO35599 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Opn1mwO35599 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Opn1mwO35599 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 273.1 ms