Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kpna4O35343 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kpna4O35343 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Kpna4O35343 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kpna4O35343 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kpna4O35343 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kpna4O35343 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kpna4O35343 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kpna4O35343 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kpna4O35343 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kpna4O35343 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kpna4O35343 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kpna4O35343 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kpna4O35343 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kpna4O35343 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kpna4O35343 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kpna4O35343 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kpna4O35343 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kpna4O35343 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kpna4O35343 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kpna4O35343 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Kpna4O35343 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kpna4O35343 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kpna4O35343 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kpna4O35343 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kpna4O35343 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kpna4O35343 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kpna4O35343 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Kpna4O35343 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kpna4O35343 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kpna4O35343 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kpna4O35343 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kpna4O35343 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kpna4O35343 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Kpna4O35343 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kpna4O35343 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kpna4O35343 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kpna4O35343 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kpna4O35343 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kpna4O35343 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kpna4O35343 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kpna4O35343 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kpna4O35343 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kpna4O35343 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kpna4O35343 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kpna4O35343 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kpna4O35343 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kpna4O35343 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kpna4O35343 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kpna4O35343 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Kpna4O35343 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kpna4O35343 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kpna4O35343 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kpna4O35343 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kpna4O35343 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kpna4O35343 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kpna4O35343 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kpna4O35343 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kpna4O35343 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kpna4O35343 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kpna4O35343 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kpna4O35343 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kpna4O35343 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kpna4O35343 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kpna4O35343 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kpna4O35343 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Kpna4O35343 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Kpna4O35343 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kpna4O35343 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kpna4O35343 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Kpna4O35343 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kpna4O35343 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kpna4O35343 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kpna4O35343 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kpna4O35343 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kpna4O35343 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kpna4O35343 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kpna4O35343 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kpna4O35343 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kpna4O35343 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kpna4O35343 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kpna4O35343 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kpna4O35343 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kpna4O35343 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kpna4O35343 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Kpna4O35343 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kpna4O35343 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kpna4O35343 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kpna4O35343 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kpna4O35343 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kpna4O35343 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kpna4O35343 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Kpna4O35343 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kpna4O35343 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kpna4O35343 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kpna4O35343 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kpna4O35343 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Kpna4O35343 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kpna4O35343 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kpna4O35343 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms