Protein–RNA interactions for Protein: O35218

Cpsf2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf2O35218 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cpsf2O35218 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cpsf2O35218 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cpsf2O35218 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cpsf2O35218 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cpsf2O35218 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cpsf2O35218 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cpsf2O35218 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cpsf2O35218 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cpsf2O35218 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cpsf2O35218 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cpsf2O35218 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cpsf2O35218 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cpsf2O35218 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cpsf2O35218 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cpsf2O35218 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cpsf2O35218 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cpsf2O35218 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cpsf2O35218 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cpsf2O35218 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cpsf2O35218 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cpsf2O35218 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cpsf2O35218 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cpsf2O35218 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cpsf2O35218 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Cpsf2O35218 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cpsf2O35218 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cpsf2O35218 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cpsf2O35218 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cpsf2O35218 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cpsf2O35218 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cpsf2O35218 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cpsf2O35218 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cpsf2O35218 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cpsf2O35218 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cpsf2O35218 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Cpsf2O35218 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cpsf2O35218 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cpsf2O35218 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Cpsf2O35218 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cpsf2O35218 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cpsf2O35218 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cpsf2O35218 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cpsf2O35218 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cpsf2O35218 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cpsf2O35218 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cpsf2O35218 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cpsf2O35218 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cpsf2O35218 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cpsf2O35218 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cpsf2O35218 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cpsf2O35218 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cpsf2O35218 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cpsf2O35218 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cpsf2O35218 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cpsf2O35218 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cpsf2O35218 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cpsf2O35218 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cpsf2O35218 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cpsf2O35218 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cpsf2O35218 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cpsf2O35218 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cpsf2O35218 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cpsf2O35218 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cpsf2O35218 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cpsf2O35218 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cpsf2O35218 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cpsf2O35218 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cpsf2O35218 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cpsf2O35218 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cpsf2O35218 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cpsf2O35218 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cpsf2O35218 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cpsf2O35218 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cpsf2O35218 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cpsf2O35218 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cpsf2O35218 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cpsf2O35218 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cpsf2O35218 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cpsf2O35218 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cpsf2O35218 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cpsf2O35218 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cpsf2O35218 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cpsf2O35218 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cpsf2O35218 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cpsf2O35218 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cpsf2O35218 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cpsf2O35218 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cpsf2O35218 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cpsf2O35218 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cpsf2O35218 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cpsf2O35218 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cpsf2O35218 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cpsf2O35218 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cpsf2O35218 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cpsf2O35218 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cpsf2O35218 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cpsf2O35218 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cpsf2O35218 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cpsf2O35218 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms