Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Kcns1O35173 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcns1O35173 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcns1O35173 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcns1O35173 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcns1O35173 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcns1O35173 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcns1O35173 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcns1O35173 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcns1O35173 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcns1O35173 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcns1O35173 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcns1O35173 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcns1O35173 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcns1O35173 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcns1O35173 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcns1O35173 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcns1O35173 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcns1O35173 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcns1O35173 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcns1O35173 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcns1O35173 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcns1O35173 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kcns1O35173 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcns1O35173 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcns1O35173 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcns1O35173 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcns1O35173 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcns1O35173 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcns1O35173 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcns1O35173 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcns1O35173 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcns1O35173 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcns1O35173 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcns1O35173 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcns1O35173 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcns1O35173 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcns1O35173 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcns1O35173 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcns1O35173 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcns1O35173 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Kcns1O35173 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcns1O35173 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcns1O35173 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcns1O35173 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcns1O35173 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcns1O35173 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcns1O35173 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcns1O35173 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcns1O35173 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcns1O35173 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kcns1O35173 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcns1O35173 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcns1O35173 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcns1O35173 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcns1O35173 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcns1O35173 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcns1O35173 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcns1O35173 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcns1O35173 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcns1O35173 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcns1O35173 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcns1O35173 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcns1O35173 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcns1O35173 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcns1O35173 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcns1O35173 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcns1O35173 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcns1O35173 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcns1O35173 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcns1O35173 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcns1O35173 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcns1O35173 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcns1O35173 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcns1O35173 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcns1O35173 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcns1O35173 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcns1O35173 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcns1O35173 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcns1O35173 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcns1O35173 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcns1O35173 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcns1O35173 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcns1O35173 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcns1O35173 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcns1O35173 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcns1O35173 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcns1O35173 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcns1O35173 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcns1O35173 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcns1O35173 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcns1O35173 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcns1O35173 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcns1O35173 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcns1O35173 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcns1O35173 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcns1O35173 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcns1O35173 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kcns1O35173 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcns1O35173 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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